hpc 相关问题

高性能计算（HPC）是指使用超级计算机和计算机集群来解决各种计算密集型问题。

在PBS中，可以使用qstat -f查询特定作业，并获取（全部？）信息和详细信息以重现该作业：＃qstat -f 1234作业ID：1234.login Job_Name = job_name_here Job_Owner = user @ ...

hpc slurm

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[使用python提交slurm作业

所以我的foo.sh如下＃！/ bin / bash #SBATCH-研究#SBATCH -p long #SBATCH --mem-per-cpu = 1024 #SBATCH -N 1 #SBATCH -n 24 #SBATCH- t 2-00：00：00 #SBATCH --mail-type = END #SBATCH --exclude = node37 ...

python bash hpc sbatch

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如何在群集上存储TB大小的C ++阵列

我想做一个巨大的仿真，需要大约1 TB的数据来描述一堆相互作用的粒子（每个粒子都有不同的相互作用）。是否可以将此数据存储在C ++数组中？我有...

c++ memory-management heap-memory large-data hpc

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即使我们具有单节点多GPU设置，也要限制MPI在单个GPU上运行

我是分布式计算的新手，我正在尝试运行一个使用MPI和ROCm（AMD框架在GPU上运行）的程序。我用来运行程序的命令是mpirun -np 4 ./a.out但这是...

mpi distributed-computing gpgpu hpc

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Snakemake：如何实现将输入/输出文件复制到tmp文件夹并从中复制规则并在其中应用规则的机制

我们使用Slurm工作负载管理器将作业提交到我们的高性能集群。在作业运行期间，我们需要将输入文件从网络文件系统复制到节点的本地文件系统，然后运行...

hpc slurm snakemake tmp

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如何在OpenMP中实现MPI_MINLOC？

如何使用C语言在OpenMP中计算全局最小值和附加到最小值的索引？我可以用很少的线程获得真正的好处吗？

c mpi openmp hpc reduction

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用python3查找并移动路径名带有文件的文件>>

我正在尝试从我的perl脚本中重新创建python脚本，以找到所有通用名称为model1_r.pdb的文件，并将它们移动到新文件夹，其名称与先前的现有文件夹相同。这是...

python perl hpc sys

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dask。分布式SLURM群集Nanny超时

我正在尝试使用dask.distributed.SLURMCluster将批处理作业提交到超级计算集群上的SLURM作业计划程序。所有作业均按预期提交，但在一分钟后...

dask hpc slurm dask-distributed

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如何比较两个列表并提取位置，索引和邻居？

假设我们有两个列表：list1 = [1、2、3、4、5] list2 = [6、7、8、9、10]这是基本结构：列行0 1 2 3 4 0 1 2 3 4 ...

python numpy list-comprehension hpc

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HPC语-如何使HPC节点同时运行多个作业的bash脚本

假设我有一个HPC集群，其中有一个节点（node_1），我想同时在node_1中发送和运行3个作业的bash脚本。到目前为止，当我将作业发送到node_1时，节点一直处于繁忙状态，直到...

nodes jobs hpc slurm multiple

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准备科学程序员/ HPC程序员面试

您能推荐来源/文学作品来为《科学程序员》 /《 HPC程序员访谈》做准备吗？谢谢！

hpc scientific-computing

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在群集的节点上启动Jupyter笔记本计算机（高性能计算或HPC设备）

我想在集群的节点上而不是登录节点上运行jupyter notebook。我可以在登录节点上远程运行jupyter笔记本，但这会不必要地减慢群集的使用。 ...

jupyter-notebook cluster-computing hpc pbs qsub

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如何在Linux HPC群集上发现高性能网络接口？

我有一个分布式程序，该程序与在HPC群集上运行的ZeroMQ通信。 ZeroMQ使用TCP套接字，因此默认情况下，在HPC群集上，通信将使用管理网络，因此我有...

network-programming mpi zeromq hpc

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我想在单台计算机上的ubuntu上安装并运行slurm

我想在单台计算机上的ubuntu上安装并运行slurm。我只想运行一些示例示例。这可能吗？？如果可能的话，我该如何安装和运行它。我已经在Google上搜索过...

hpc slurm

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“在Centos 7上安装preCICE之后输出错误命令”>

在Centos 7上的preCICE中运行make test命令后，出现以下错误。有人遇到此问题吗？谢谢...构建cmake3时的cmake参数.. -DBUILD_SHARED_LIBS = ON -...

linux centos7 hpc

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IBM Spectrum LSF-访问不同HPC节点上的多个GPU

我正在尝试使用多个GPU：总共8个GPU，每个节点4个GPU设备，总共：2个节点。到目前为止，我遇到了一个``内存不足错误''：我检查了我的tensorflow代码的部分输出，并且只有4 ...

python-3.x gpu tensorflow2.0 hpc lsf

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[pip脱机安装软件包[重复]

我想在未连接到外部世界的群集上安装python3软件包（在这种情况下为torch和torchvision）。我试图做pip3下载然后...

python python-3.x pip installation hpc

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python3：离线安装pip软件包

我想在未连接到外部世界的群集上安装python3软件包（在这种情况下为torch和torchvision）。我试图做pip3下载然后...

python pip installation hpc

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PBS集群节点上的多处理

我必须使用不同的参数（或随机数生成器种子）对同一模型进行多次仿真。以前，我在具有许多核心的服务器上工作，在这里我使用了python multiprocessing ...

python multiprocessing hpc pbs

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编辑一个已提交的Pbs作业的Job ID号，以使其在队列中的其他作业之前完成提交

亲爱的UNIX / PBS专家：我是UNIX HPC系统（CentOS Linux 7（核心），Linux 3.10.0-693.5.2.el7.x86_64）的用户，我没有任何root特权。在HPC系统上已提交了各种作业...

linux unix hpc pbs

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