igraph是一个免费的软件包,用于创建和操作大型无向和有向图。它是用C语言编写的,但是具有与R,Python或Ruby等高级语言的接口。
我需要一个循环来重复计算变量,考虑到 0.0 到 2.0 之间的所有分辨率级别。然后构建一个曲线图,显示哪个值最主要,无论......
cdlib和igraph的variation_of_information结果不同
假设我们有两个社区分区,如下所示: 社区分区1 社区0= [8, 16, 17, 19, 20, 21, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33] 社区 1= [1, 2, 3, 7, 11, 12, 13, 15, 18]
我尝试将 set_vertex_attribute 设置为图形,并注意到该函数错误地分配了属性。此处报告了类似的问题:R - 顶点属性 - '不适当的值...
我一直在努力使用 igraph,似乎没有找到为我提供所需结果的文档。 我有一个 igraph 对象,比方说 g1,它包含在获得 f 的网络中......
我是 igraph 新手。我尝试了这个简单的代码,但它没有显示节点内的 vertiex id。 从 igraph 导入 * g = 图() g.add_vertices(3) g.add_edges([(0,1), (1,2)]) 绘图(g,布局= g。
我有一个如下所示的网络图,其中我对特定节点进行了分类,与不同的绿色阴影相关联。为了让颜色更突出,有没有办法去除黑色轮廓...
首先,我尝试计算具有 N=3015 个节点的边权重的全连接有向图的介数中心性。 Matlab 可以在大约 30 秒内完成此操作,而 Python igrap...
我手动创建了一个 igraph,如下所示。我创建了一个标记为 1 到 4 的“等级”的顶点属性。当我创建图形时,我希望排列顶点或...
我正在使用 R 中的加权无向网络。我有一个直接连接的边和它们之间的权重的列表。权重表示顶点之间的距离。我想要...
我正在研究参与内战的参与者网络,其中每个参与者都被表示为一个顶点,它们之间的连接(边)表示冲突或战斗的实例。通过新...
我尝试了 make_tree() 的副本: 图书馆(igraph) 我的乐趣 <- function (n, children = 2, mode = c("out", "in", "undirected")) { mode <- igraph.match.arg(mode) ...
我有 AD 组成员资格,格式如下: 在此处输入代码 # 源数据格式代码 df <- data.frame( Parent_Group = c('A', 'A', 'A', 'A', 'A', 'A', 'A', 'B', 'B', 'B', 'B', 'B'), Gro...
我正在 R 中解决一个有趣的问题(可能使用 igraph 和/或 tidygraph 库),我需要在图表上找到满足某些条件的所有可能路径。问题可能是
我正在用Python编写重叠社区检测代码并评估我的结果,我尝试使用igraph模块化方法。但我无法弄清楚如何让它与我的总体工作......
我正在努力寻找一种设置来防止矩形顶点连接到错误的(又称远程)一侧。对于有向图,问题在于 e 的输出端和输入端......
Cluster_leiden(),什么是/在哪里可以找到结果对象中$quality值的含义?
以下代码 图书馆(igraph) 克<- make_ring(5) set.seed(1) cle <- cluster_leiden(g, resolution=1, objective_function=c("CPM", "modularity")[1]) modularity(g, member...
来自 igraph 文档:“两个顶点的 Jaccard 相似系数是共同邻居的数量除以至少其中一个顶点的邻居的顶点数量...
我有一个像这样的图形对象: # 创建一个空图 GS <- make_empty_graph(n = 12, directed = FALSE) # Define vertex attributes vertex_attr(gss) <- list( name = c("1", &quo...
如何使用 R 中的 igraph 包计算图形或网络中 2 星或楔形的数量
igraph 包提供了非常有效的计算图形或网络中三角形数量的方法,即 count_triangles() 函数。 我无法使用
我有一些数据 CM(如下),其中包含 6 个基因组。图中的一些基因重叠。我创建了一个维恩图,但我的主管希望数据以不同的格式呈现。他们...