imagej 相关问题

ImageJ是一个基于Java的开源图像处理程序,广泛用于科学图像分析,特别是生命科学。请考虑在Image.sc论坛上询问ImageJ特定的问题:https://forum.image.sc/tags/imagej。此标记应用于有关ImageJ中/的编程问题。

正则表达式在Java中识别前面有0的整数

我正在 ImageJ 中开发一个宏,它将循环遍历一系列具有标准格式的图像,并将它们作为两个不同的通道合并在一起。我已经写了宏,但我需要它...

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斐济反卷积使16位图像变成32位

我有 16 位图像,需要使用斐济反卷积实验室对其执行一些反卷积,特别是 Richardson Lucy 算法并使用点扩散函数 (PSF),但是当我...

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层厚计算复杂分割

我目前正致力于测量图像 J 中 OCT 的图像层。但是,我在分割方面遇到了麻烦。我最初正在使用 Image J 创建宏。然而我...

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如何在Gitlab CI/CD中使用Fiji作为可执行文件?

我对 Fiji 及其用法还很陌生,所以我想问一下如何在 Gitlab CI/CD 中使用它。 我使用了一个 cython 文件,我在其中初始化了 Fiji。这个我转成C文件,然后用GCC来

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量化z栈图像j

对于 z 堆栈图像中的 MAS 蛋白质的量化,我首先进行 MaxIntensity Z 投影,然后使用 Background Substruction 工具减少背景。 在这一点上,我可以轻松地制作一个 ...

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open cv 代码裁剪图像 56 次,每个裁剪图像具有与原始图像相同的元数据

(我对这整个公开简历都是新手) 我的裁剪方法是点击图像左上角附近你想要第一个框的点,点击的点将是

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是否有像 tifffile 这样的开放式 cv 库,但在裁剪后不会隐式减少图像?

我需要帮助编写代码,该代码使用开放的 cv 库读取图像并写入完全相同的图像而不改变任何像素质量。我测试了看问题是来自 imread 还是

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ImageJ / Fiji 在视频中显示错误的帧数(FFMPEG 导入)

我正在统计斐济一个地区的动物数量。我通过 FFMPEG 插件导入视频(视频是带有 mpeg-4 编解码器的 mp4)。但是,我注意到当我导入视频时 Fiji

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imageJ如何从照片中提取颜色粒子?

我最近在做沉积物分析,想应用imageJ来帮助我计算普通沙子中的示踪颗粒。我有一张照片,现在想学习如何计算粉红色沙粒...

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Imagemagick:如何增加二值图像中的颜色数量?

这是一张黑白图像。它的调色板仅由两种颜色组成。 当我尝试在 ImageJ(斐济)中对此图像进行阈值处理时,它无法执行此操作,因为该图像只有两种颜色。 (我不知道...

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如何应用高斯锐化滤波器?

高斯滤波器内核已经给出,我如何推导出基于高斯滤波器的锐化滤波器?最终的过滤器内核是什么? 1/273 在此处输入图片描述 我用了equati ...

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FIJI/ImageJ 宏不保存每个分析粒子结果和汇总表

我有一个包含多个 Tif 图像的文件夹,我希望使用分析粒子功能来分析粒子。我需要一个通道,其所有 z 堆栈切片都将被分析并保存到一个 fo...

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SimpleITK.Show() 在 Linux 上的 ImageJ 中生成错误

编辑注意: 这个问题最初被表述为 如何在 Linux 中将 SimpleITK.Show() 链接到 imageJ? 通过将 SimpleITK 1.0.0 升级到 1.0.1,我能够从 SimpleITK.Show() 启动 ImageJ。然而...

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在 ImageJ 中顺序打开文件时验证文件是否丢失的条件或函数

我正在使用一个 ImageJ 宏,它打开并处理来自几个按顺序命名的样本的一组图像——例如sample1_image1.tif,sample1_image2.tif,sample2_image1.tif,(...)。我用的是lo...

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用于 RAW 图像导入的 dtype=uint10、uint12、uint14 的 Numpy 解决方法

将 16 位无符号原始(图像)数据导入 python 很简单: 数据 = numpy.fromfile( source_file, dtype=numpy.uint16 ) 数据 = numpy.asarray( 数据 ) 但我还必须导入 10、12 和 14 位元...

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我们可以使用imagej软件分析SEM图像的机械性能(韧性,弯曲强度,硬度)

我们可以使用imageJ软件分析SEM图像的机械性能(韧性,弯曲强度,硬度)。 我们问的问题的正确答案

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在ImageJ中批量测量曲线的面积和长度。

这是我的参考图片,StackOverflow不允许我把它嵌入到这个帖子里。我想知道是否可以用ImageJ或者其他免费软件来测量所有的长度 ...

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imageJ宏将每个子文件夹作为堆栈打开,并 "做一些事情"

大家好,我有一个文件夹,里面有多个子文件夹,每个子文件夹里面有18个数量的tif(.tif)文件。我想在imageJ中把每个子文件夹的文件作为堆栈打开。用一些在线宏...

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将Weka Fiji插件细分导出为ROI

我正在使用Imagej / Fiji Weka插件对图像的不同区域进行分类,我想获得这些区域以进行进一步处理……(如Rois?带有类的表?)最后我……

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基于ImageJ的x坐标值重命名ROI以创建序列

经过数小时的深入搜索,我需要问你。因此,几天前,我获得了可根据半径和函数(最大)有效创建ROI的宏。链接我的起点...

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