mcmc 相关问题

马尔可夫链蒙特卡罗（MCMC）方法是一类基于构造马尔可夫链的概率分布抽样算法，该马尔可夫链具有所需的分布作为其均衡分布。然后将多个步骤之后的链状态用作所需分布的样品

如何在stan / pystan中包括数据测量不确定度

我对斯坦完全陌生。我只是想拟合在测量中具有不确定性的数据，但无法在拟合中包括不确定性。例如，我有x [N]，y [N]和yerror [N] ...

python montecarlo mcmc stan pystan

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Mamba软件包和JuMP软件包型号警告

我有一段代码，其中我正在使用JuMP和Mamba，并且它们都导出了Model。当我第一次运行代码时，我得到一个警告：Mamba和JuMP都导出“模型”；在QuantumRelay模块中的使用...

julia linear-programming mcmc

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[MCMCglmm数据格式困难

我想使用动物模型来估计动物性状的遗传力。但是，我不知道如何正确格式化数据，以便MCMCglmm可以创建模型。经过反复试验...

r modeling glm mcmc

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有多个变量的观测pymc

我使用的是来自黑客的贝叶斯方法线性回归的一个例子，但有麻烦它扩展到我的使用。我有一个随机变量，对假设的分布观察...

python bayesian pymc3 pymc mcmc

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PyMC混合模型的AIC＆BIC

我使用PyMC一些数据拟合一条直线。该数据有异常，所以我适应由杰克Vanderplas他的教科书编写一些代码（在链路第三个例子）。该方法使用矢量...

python bayesian pymc mcmc model-comparison

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如何建立三次翻转硬币的贝叶斯仿真模型

想象一下，我们扔了一个有偏见的硬币8次（我们不知道它是多么有偏见），到目前为止我们记录了5个头（H）到3个尾（T）。接下来的3次投掷都是尾巴的概率是多少？在......

python bayesian pymc3 mcmc

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为什么我的python实现大都市算法（mcmc）这么慢？

我正在尝试在Python中实现Metropolis算法（Metropolis-Hastings算法的简单版本）。这是我的实现：def Metropolis_Gaussian（p，z0，sigma，n_samples = 100，...

python performance machine-learning random mcmc

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了解mcmc包中使用的错误估计

我正在从R中的包mcmc查看MCMC示例教程。下面给出了代码，其中MCMC用于在逻辑回归示例中计算参数。图书馆（mcmc）......

r bayesian mcmc

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用给定的静止向量计算马尔可夫链

我正在蒙特卡洛课程中做作业，我被要求找到一个马克夫链的矩阵，有6个状态，分别为0,1,2,3,4,5，这样经过足够长的时间我们就花了时间。。

python markov-chains mcmc

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如何使用具有自定义日志概率的MCMC并解决矩阵问题

代码在PyMC3中，但这是一个普遍的问题。我想找到哪个矩阵（变量组合）给我最高概率。取每个元素的痕迹的平均值是......

pymc3 pymc mcmc

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加速Metropolis - Python中的黑斯廷斯

我有一些代码使用MCMC对后验分布进行采样，特别是Metropolis Hastings。我使用scipy生成随机样本：从scipy import stats def中导入numpy as np ...

python numpy random numba mcmc

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使用确定性分布的PyMC3代码中的AssertionError

在过去的几天里，我一直在努力习惯PyMC最终从一些我直接编码的模型中做一些MCMC的分布抽样（我最终对参数感兴趣......

python theano pymc pymc3 mcmc

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如何在R2jags :: jags中修复“节点与父节点不一致”

我正在使用R-package R2jags。运行下面附带的代码后，R生成错误消息：“节点与父节点不一致”。我试着解决它。但是，错误消息仍然存在....

r bayesian mcmc jags r2jags

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运行Jags - 从mcmc对象中提取多个实现

我有一个runjags脚本，可以为岛上的每个细胞生成预测的洞穴密度。我希望从每个单元格的mcmc对象中获取多个绘图（大约100个）。我的论文......

mcmc jags coda runjags

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如何正确地截取截断的分布？

我正在尝试学习如何对截断的分布进行采样。首先，我决定尝试一个简单的例子，我在这里找到的例子我并不真正理解CDF的划分，因此我......

python numpy random probability mcmc

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我应该如何在PyMC中使用@ pm.stochastic？

相当简单的问题：我应该如何使用@ pm.stochastic？我已经阅读了一些声称@ pm.stochasticexpects负日志值的博客帖子：@ pm.stochastic（observed = True）def loglike（value = data）：＃...

python pymc mcmc

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用R中的一组beta进行预测

假设我使用MCMC进行Beta后期绘制。对于每一行，我都有一组测试版。是否可以将此行的beta变为R中的模型对象，以便我可以使用predict（）函数？ ...

r regression mcmc

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