mixed-models 相关问题

与随机效应项统计模型分析相关的编程问题,也有不同的:重复测量,分层,多层次模型

在使用混合效应模型时如何解释样本随时间的重复测量

我有一个实验,在三年的时间里,我在春季和夏季反复从同一块地的内部和外部采集沉积物样本。例如,sample_IA 表示来自 plo 内部的样本...

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lme() 函数中截距的两个随机效应

我正在尝试使用 nlme 包中的 lme() 函数将两个随机效应引入到截距中。这个想法是在 nlme() 中重写 barleyprogeny1.lmer 模型。 我找到了一些资料...

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夏季套装中装有混合型号

我在文献中观察到,与经典包 nlme 或 lme4 相比,sommer 包带来了与混合模型参数推断相关的可能性。 D...

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如何在估算数据集上拟合混合效应模型?

虽然我可以使用 r 中的 psfmi_coxr() 函数在估算数据集上拟合 CoxPH 模型,但如何拟合混合效应模型?我可以查看我的 10 个估算数据框并在 t 上拟合模型...

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混合效果 MLE2 模型 r

我需要将一个瑞克模型拟合到我的数据中,该模型对每个区域都有随机影响,然后绘制输出。我使用了 How do Iplot a mle2 fit of a model in ggplot2, with the data? 中的答案以及数据? 到

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我们可以在线性混合模型中使用类似的变量作为固定效应和随机效应变量吗?

我正在做一项研究,寻找特定手术的死亡率预测因素(二元变量)。这涉及由不同外科医生在不同中心进行的 1000 次手术。我想要...

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混合模型的 R 和 SAS 中的 AIC 计算不匹配

我尝试使用 R 重现一些 SAS 输出。我想要重现的方法是: 使用混合模型对因子时间进行重复测量的双向方差分析(协方差矩阵 = CS,估计...

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R coxme:如何从混合效应模型中获得特定研究的治疗效果和 95% 置信区间?

我正在使用 coxme 修复混合效果 Cox 模型。我在模型中有两个随机效应(截距 [基线风险] 和治疗斜率)。运行模型后,我得到了固定的

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R:混合效应模型中随机效应的协方差矩阵

根据这篇文章,当我们拟合混合效应模型时,矩阵 Omega 和 sigma 在 lmer 的结果中。这是我的结果。 随机效应: 组名称方差 Std.Dev。更正

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r 中的 Lmer:正确定义了重复测量模型? (HLM)

这是我第一次与 lmer 合作,我不确定我是否做对了。 我的数据是具有变量 ID、季节、开始时间响度和训练的重复测量数据。娄...

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R 包 glmmTMB 中主观调整随机效应方差的设置?

根据我对常客层次模型的外行理解,似然函数中内置了一些惩罚机制,可以防止随机效应过度拟合数据和

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R 中的 Mlogit:数据形状

我想使用 r 包 mlogit 运行多项混合模型分析。 不幸的是我的数据结构有问题,因为 r 似乎找不到数据(下面的错误)。 Chid 是 Choi...

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如何在 ggplot2 R 中绘制多因素数据的 95% 置信区间?

df<- data.frame (yaxis = rnorm(120,5,1), xaxis = rep(c("A","B","C","D","E", "F"), times = 20), fa...

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如何通过AIC或AICc识别和比较n次混合多项式模型的所有随机变量?

请问,在R中是否有通过AIC或AICc识别和比较n次混合多项式模型的随机变量的算法或包? 示例:三等学位 lmer(y ~x + x2 + x3 ...

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使用 lme4 中的 nlmer 时出现错误“Downdated VtV is not positive definite”

我正在尝试在 R 中使用 lme4 (lme4_1.1-31) 实现 NLME 模型。 vW_start = 0.045/0.042 vK_start = exp(0.9)*vW_start vW_start = log(vW_start-1) vK_start = log(vK_start-1) b2_start = 1.718

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如果我使用随机截距模型的拟合值,为什么我的图显示随机截距?

我使用密集纵向数据计算随机截距模型,代码如下: 模型 1a <- lmerTest::lmer(MET_mean_log ~ Stress_RQ1 + Time + (1 | id), data = data_mini_clean...

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说明R中主变量和交互变量之间的交互

图书馆(ggplot2) 图书馆(lme4) 图书馆(lmerTest) 库(jtools) 设置种子(123) # 为 100 名参与者创建 1000 行的数据框,访问次数为 2-5 次 n_参与者<- 100 n_visits <- samp...

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从混合效应模型重新计算非标准化系数以进行可视化

我想通过显示边际效应来可视化我的混合效应模型的一些结果。我认为使用标准化的非标准化版本会更直观

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如何解决 R 中线性混合效应模型的 MEEM 误差? nlme 包中的 lme() 函数

我正在尝试使用 lme() 函数构建线性混合效应模型 (lmm)。为了提供一些背景信息,该研究项目将运动员反应时间的变化视为

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在 lmer (R) 中设置固定效应以在组级别变化

我正在使用 lme4 包在 R 中构建线性混合模型。我有 V1 的固定效应和 1 个随机效应(这是一个因子变量)。我的模型目前如下: 注册<- lmer(fo...

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