nlme 相关问题

用于拟合非线性混合效应统计模型的R包。

lme() 函数中截距的两个随机效应

我正在尝试使用 nlme 包中的 lme() 函数将两个随机效应引入到截距中。这个想法是在 nlme() 中重写 barleyprogeny1.lmer 模型。 我找到了一些资料...

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NLME 函数中的错误:第 0 级、第 1 块的反求解中存在奇异性

我正在尝试使用 nlme 函数将 ELISA 板数据拟合到非线性混合效应模型。之前,我询问过如何使语法适用于嵌套组,尽管回复让它看到......

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夏季套装中装有混合型号

我在文献中观察到,与经典包 nlme 或 lme4 相比,sommer 包带来了与混合模型参数推断相关的可能性。 D...

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混合模型的 R 和 SAS 中的 AIC 计算不匹配

我尝试使用 R 重现一些 SAS 输出。我想要重现的方法是: 使用混合模型对因子时间进行重复测量的双向方差分析(协方差矩阵 = CS,估计...

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lme() in R - 用于重复测量设计的线性混合模型。拟合独立斜率以确定重复测量水平内的关联?

我做了一个实验,让 30 个人随机听 3 首歌曲(“A”、“B”和“C”)。对于每个参与者和歌曲,我得到平均“体温&...

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使用 lme4 中的 nlmer 时出现错误“Downdated VtV is not positive definite”

我正在尝试在 R 中使用 lme4 (lme4_1.1-31) 实现 NLME 模型。 vW_start = 0.045/0.042 vK_start = exp(0.9)*vW_start vW_start = log(vW_start-1) vK_start = log(vK_start-1) b2_start = 1.718

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如何解决 R 中线性混合效应模型的 MEEM 误差? nlme 包中的 lme() 函数

我正在尝试使用 lme() 函数构建线性混合效应模型 (lmm)。为了提供一些背景信息,该研究项目将运动员反应时间的变化视为

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将具有相关结构的混合模型从 nlme 转换为 glmmTMB

我想在 nlme 中构建的一些平均模型上使用预测来绘制建模关系的置信区间。但是,我发现使用 nlme 和 MuMIn::model.avg 是不可能的。

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如何在lme中获取随机效应的标准误差?

如果我使用 nlme 包中的 R 的 lme 修复线性混合效应模型,我如何获得随机效应估计的标准误差? 例如,如果 lme 给出以下结果: 无效

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如何将 5 个物种的存在/不存在纳入线性混合效应模型?

我有一个数据集,包含 5 种鸟类对 3 种花的访问率 (VR),以及每朵花的花粉沉积量 (PD)。每种花卉由 20 个个体代表。不……

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作为数据框访问 intervals.lme 的结果 + r + lme

我正在使用线性混合效应模型来确定两个变量随时间变化的关系,模型 - 米姆<- lme(RBS.Score.Endorsed ~ DairyTotal, random = ~ Period|ID, data = df) I then

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varIdent 函数(nlme 包)中的引用类别取决于数据顺序

我发现函数 varIdent 具有依赖于数据顺序的不良行为。具体参考类别取决于数据顺序,见下例 设置种子(123) 图书馆(整洁...

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时间序列数据的变异函数

我想检查我的 lme 模型的时间自相关结果。数据可以在这里下载(密码:Variogram_2023)。它包含采样日期、组和提取的残差...

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为什么在lme中,一个cathegoric变量的一个层次的自由度与其他层次不同?

我在做嵌套随机效应的混合模型。当我运行模型的摘要时,我看到变量 "治疗1 "的水平 "控制无鱼 "的自由度数是11......。

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提取lme模型拟合中每个单位的系数及其标准误差。

我怎样才能提取线性混合模型中每个实验单位的系数(b0和b1)及其各自的标准误差(图)?更好的拟合线性模型与...

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错误:$操作符对使用ggplot2的原子向量无效。

我在R中使用nlme包运行线性混合模型分析,当我尝试使用ggplot绘制我的模型的结果时,我得到了上述错误。我看了stackoverflow上的其他帖子 ...

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指定对数进行对数变换以绘制反变换趋势

我已经在R中拟合了lme模型,并具有logit转换后的响应。我无法找到执行logit转换的直接命令,因此我已经手动完成了。 logitr

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从R中的lme4摘要中提取列

我想知道什么是仅提取(而不是像HERE那样打印)Std.Dev的最有效方法。下面的vc对象中的列作为矢量? library(lme4)library(nlme)data(Orthodont,package =“ ...

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0和1的分类变量编码在R中提供不同的输出

[我做了什么:我使用nlme库在R中进行了线性混合效应模型分析。我有一个类别固定的类别模糊度,分为2级:B代表模糊,N代表非模糊。在...

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估计GLS时,dimnames错误是什么?

我在Google周围搜索了很多,找不到相关的文档。我正在尝试在R中的横截面时间序列数据上估计可行的广义最小二乘(FGLS)模型。例如:...

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