openmpi 相关问题

Open MPI是Message Passing Interface的开源实现,Message Passing Interface是一个用于分布式内存并行编程的库。

如何将 Open MPI Java 绑定合并到 Maven 插件中?

我为开源生物信息学Java应用程序Cytoscape开发了一个基于maven的插件(或应用程序)。我想知道是否可以将 Open MPI Java Bindings 合并到这个项目中。我的...

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Mpiexec 需要永远启动(可能是 MPIPoolExecutor 的问题)?

我正在尝试运行以下命令: mpiexec -n 1 python scrap.py 其中 scrap.py 是此处提供的一个简单示例 从 mpi4py.futures 导入 MPIPoolExecutor 定义平方(i): 全局初始化...

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Slurm MPI 错误:ORTE 守护进程失败

我在集群上使用 Slurm 和 openMPI 时遇到了一些问题。每当我运行任何使用 mpirun 的作业时,都会收到以下错误: -------------------------------------------------- ----------...

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mpirun 无法导入已安装的软件包

我正在运行 qiskit 代码,当我使用 python3 调用它时,它执行得很好,但是当使用 mpirun 调用时,它会执行 SegmentationFault Errormentioning 一些权限错误。我以 root 身份运行命令,它

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确定性地将 Open MPI 等级绑定到 NUMA 节点核心的输入

尝试将 Open MPI 等级绑定到 NUMA 节点计算机上的每个核心。 该机器有 2 个节点,每个节点有 12 个核心。 节点没有名称,所以我无法执行 --host a:12,b:12 我也想...

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与 conda 安装时如何设置 openmpi C 编译器?

我使用 anaconda conda-forge 通道将 openmpi v4.1.6 (和依赖项)安装到干净的环境中。安装并尝试编译后,出现错误 --------------------------------...

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Openmpi 编译错误:mpicxx.h“在数字常量之前需要标识符”

我正在尝试使用 openmpi 编译一个程序,我的代码没有给出任何错误,但 mpi 标头之一却出现了: /usr/include/openmpi-x86_64/openmpi/ompi/mpi/cxx/mpicxx.h:168:错误:预期

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如何从 mpirun 在 gnome 终端中运行 gdb?

我有一个使用 mpi 的程序。要调试它,我可以使用 mpirun -np 2 xterm -e gdb myprog。 然而,xterm 在我的机器上有问题。我想尝试 gnome-terminal 但我不知道该输入什么。我有...

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由于文件 libmpi.so.1 丢失而出现错误

我正在使用 Omnet++ 和 Veins 进行模拟,直到我昨晚从 Ubuntu 15 升级到 16.04 LTS 之前它都工作正常。现在,我在尝试运行模拟时收到以下错误: error wh...

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如何跨不同主机上的多个 docker 容器运行 mpirun 命令

设置说明: N 个主机包含相同的启用 mpi 的 docker (openmpi) 映像。 每个主机包含一个图像 目标: 执行包含对 mpirun 的调用的 python 脚本(通过子进程...

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mpirun 无法启动指定的应用程序,因为它无法访问或执行 R 中的可执行文件

我正在尝试在加拿大计算上运行 irace,当我使用 openmpi 模块时,它总是给我以下错误消息: mpirun 无法启动指定的应用程序,因为它无法访问...

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如何在 Intel Mac 上将 OpenMPI(或其他)与 CLion 集成?

最近我尝试在 Intel Mac 上将 OpenMPI 与 CLion IDE 集成。我安装了 Open MPI 酿造安装openmpi 现在,据我所知,我必须在 CMakeLists.txt 中进行一些更改才能使其工作......

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如何安装 OpenMPI、MPICH 和其他 MPI 变体,以便它们仅在本地运行,而不是全局运行?

我想要做的是安装各种版本的 OpenMPI、MPICH 等,这样我就可以专门为这些版本运行代码,但它们不会相互混淆。 我刚开始使用...

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CentOS 7 未定义符号:ompi_mpi_逻辑8

我正在尝试在 CentOS 7 计算机上安装依赖于 mpi4py 的 python(3) 软件包。 我尝试了多种方法来做所有事情,甚至从干净的 virtualenvs 开始,但我不断得到:

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Ubuntu 升级到版本 22.04 后如何修复损坏的 openmpi

我认为将 Ubuntu 升级到版本 22.04 后,我的系统中的 openmpi 被破坏了。 总而言之: 我收到与 openmpi-bin 相关的错误。例如: >sudo dpkg --配置 openmpi-bin dpkg:错误

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libmpi_cxx.so.40:无法打开共享对象文件

运行需要 mpi 的命令时,它会失败并显示 加载共享库时出错:libmpi_cxx.so.40:无法打开共享对象文件:没有这样的文件或目录 我在 conda 中运行它

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Slurm 中的 GPU 分配:--gres 与 --gpus-per-task,以及 mpirun 与 srun

Slurm 中有两种分配 GPU 的方法:要么是通用的 --gres=gpu:N 参数,要么是特定的参数,如 --gpus-per-task=N。还有两种方法可以在批处理 SC 中启动 MPI 任务...

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netCDF Fortran 编译问题:C 编译器不起作用

我在 netCDF Fortran 编译方面遇到问题。这是我的编译的输出: 配置:netCDF-Fortran 4.5.3 检查构建系统类型... x86_64-pc-linux-gnu 检查主机系统类型...

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在环境模块中设置 open-mpi

我尝试在环境模块中设置开放的 mpi。 首先,当我使用这个命令时: module load mpi/openmpi-x86_64 ,错误: ModuleCmd_Load.c(213):ERROR:105: Unable to locate a

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如果数据不可分割我的 COMM_SIZE,比循环 MPI_Senc/MPI_Recv 更好的方法?

我使用 MPI 程序来并行化批处理。 成像多维 MRI 图像(3 个空间维度、线圈数据……),我们将其中的几个图像聚集在一个批次维度上。 该程序显示...

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