此标记引用Python调试器。有关蛋白质数据库文件格式的问题,请使用protein-database标签。
我想知道 Bio.PDB 如何将残基识别为异质残基。 我知道residual.id方法返回一个元组,其中第一项是异质标志,第二项是残基iden...
如何使用Bio.PDB.Selection仅展开蛋白质原子?
从 Bio.PDB 导入 PDBParser 从 Bio.PDB 导入选择 Structure = PDBParser().get_struct('4GBX', '4GBX.pdb') # 加载你的分子 atom_list = Selection.unfold_entities(结构[0]['E'], '...
HI 我遇到 PDB 数据库问题我检查了 PDB ORC1PDB 受到限制... CON_ID CON_NAME 开放模式受限 ---------- ------------------------------ -----...
如何使用 pdb.set_trace() 跳过循环? 例如, pdb.set_trace() 对于范围(5)内的 i: 打印(一) 打印('完成!') pdb 在循环之前提示。我输入一个命令。所有 1-5 值均为
跨越“raise Exception from e”边界来调试原始异常“e”[重复]
我经常发现自己调试的代码看起来像这样: 定义 fn(a): 如果a!= 5: 引发 ValueError('错误') 尝试: fn(a=4) 除了异常 e: 引发运行时错误('抓住它'...
我正在学习编程,刚刚切换到使用 Python 语言进行问题集。之前,我学过写一些C小程序。所以当我调试C程序时,我使用了gdb和显示
最近将 pdb 调试器添加到我的 Python 2.7.10 代码中时,我收到以下消息: 回溯(最近一次调用最后一次): 文件“/Users/isaachess/Programming/vivint/Platform/MessageProcessing/
R语言使用read.pdb文件来读取单个蛋白质。 p= read.pdb(D:/R/1XYZ.pdb) 我希望 R 从文件夹中读取多个 pdb 文件然后存储它。有代码吗
如何在SublimeREPL中隐藏pdb调试模式下的文件路径输出?
当我在SublimeREPL中使用pdb调试模式时,我注意到它输出了文件路径,如下所示: c:\users\xiakn\desktop\search.py(1)() -> 导入请求 (Pdb) n c:\我们...
我一直在尝试让 TAB 执行其他操作,而不是在 (pdb) 提示符下插入选项卡。 我的想法是触发自动完成,例如此处或此处,但 Tab 键不起作用
我有一个 .pdb 文件,它对应于肽-蛋白质复合物。该文件的片段如下所示: 原子 47 CD GLU 5 -27.358 -23.727 15.778 0.00 0.00 ATOM 48 OE1 GLU ...
我在我的项目 c# 项目中使用 CefSharp 程序集作为参考。即使在“高级构建设置”对话框中将“调试信息”设置为“无”之后,我仍在生成 PDB 文件...
想象以下场景:脚本从 IPython shell 启动,并在断点处调用 python 调试器。使用 PDB 命令可以分析此处的代码和变量 ...
使用 pdb 高效调试 Django – 就像 Sentry
我在Django中使用pdb调试。有时它有效,有时它没有发现问题,只是运行错误。我还有另一个例子,哨兵显示错误的方式。正好在...
我有一个最小的工作示例代码: 测试.py: 一 = 4 b = 6 l = [4, 6, 7, 8] 对于 l 中的 t: 如果 t == a 或 t == b: 继续 打印(t) 我正在使用 pdb (python-...
Python 在 Cython 文件中存储断点变量状态 - sklearn
我想在sklearn.tree被构建的时候对一些变量进行快照,但很难让它工作。例如,在下面这几行代码后面,从sklearn.datasets导入......。
如果列表理解中的子句在pdb中给出了未定义名称的错误,但在解释器中没有。
抱歉,标题太差。我必须弄清楚术语,并试图把所有相关的点放在那里。考虑以下Python中的简单交互。Python 3.6.9 (默认,7月21日......)
我想让我的调试器在遇到异常时随时运行post_mortem(),而不必修改我正在处理的源代码。我看到很多例子都涉及到用try包装代码......。
为什么pdb.set_trace()没有进入下一行,而是进入了interactivehell.py?
我使用pdb.set_trace() +n来检查每一行代码。大多数情况下,它是有效的。我现在有一段新的代码,我在for循环之前设置了跟踪。当我点击'n'时,不是去 ...
我是webscraping新手,想在一个pdb网页上达到每个pdb ID,如:url= https:/www.rcsb.orgsearch?request=%7B%22query%22%3A%7B%22parameters%22%3A%7B%22attribute%22%3A%......