rpy2 相关问题

RPy是R编程语言的一个非常简单但强大的Python接口。它可以管理各种R对象,并可以执行任意R函数(包括图形函数)。 R语言中的所有错误都将转换为Python异常。可以在Python中使用为R系统安装的任何模块

rpy2:最新版本在Ubuntu上不起作用

[当我从rpy2.robjects导入r执行操作时,我得到一个错误:>>>从rpy2.robjects导入r追溯(最近一次调用最近):文件“ ”,第1行,位于[[文件“ / ..中。 。

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如何使用rpy2 api从python脚本正确获取R sessionInfo()?

我正在尝试通过在python脚本中使用rpy2获得R sessioninfo(),原因是我要从python进行api调用到自定义R库。我想尝试的基本方法是获取当前R ...

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如何通过Rpy2(v3)在Python中使用R中的`hclust`函数?

rpy2 v2和v3之间有很多更改。我正在移植代码并修补一些兼容性问题。我不知道的一件事是如何使工作变得活跃。特别是从...

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为rpy2转换python对象

以下代码应该在rpy2中创建一个热图,从py2导入numpy作为np。robjectsimport r data = np.random.random((10,10))r.heatmap(data)但是,结果如下...

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在库'/usr/lib/R/lib/libR.so'中找不到rpy2错误符号'R_tryCatchError'

Python:3.7.6 rpy2:3.2.7 R:3.3.3我正在AI平台上使用GCE进行一些聚类。我已经安装了r-base,已正确更新,安装了python-rpy2,但出现此错误。 ...

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使用jsonlite序列化mgcv gam模型时出错

我想以健壮的方式“序列化”带有jsonlite的mgcv gam模型,以便以后在rpy2中使用它。 (我的意思是robust:在使用python时,我认为Pickle并不健壮,因为...

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[使用rpy2从Python调用自定义函数

有没有一种方法可以调用文件中定义的函数,例如myfunc.r --------------- myfunc.r -------------- myfunc = function(){return(c(1,2,3,4,5,6,7,8,9,10))} getname = function(){return(“ chart ...

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在python中使用pickle时发生内存泄漏

我有一个大型的pickle文件,其中包含数百个经过训练的python r-model:这些是使用rpy2库构建的统计模型。我有一个类,每当它的一个方法...时都会加载泡菜文件...

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如何在Jupyter中使用rpy2设置自定义R安装?

我有一个conda环境,可以通过运行以下命令将它作为Jupyter实例的内核使用:python -m ipykernel install --user --name my-env-name --display-name“ Python(my-env-name )“使用此...

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rpy2不会在Mac上安装,而不是目录:'/ usr / local / bin / R / bin / R'

为什么要在Mac上安装rpy2 noy?我的意思是根据每个Rpy2文档,其中R / usr / local / bin / R python3 setup.py build --r-home / usr / local / bin / R install引发child_exception_type(errno_num,...

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使用Python创建R的公式

我正在编写一个使用Python与R交互的程序。基本上,我有一些R库要提取到我的Python代码中。下载rpy2之后,我定义了我想要的R函数...

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将Pandas df转换为rda文件

我正在用Python清理数据,但是我们为R设置了用于可视化的程序。我试图将数据帧另存为rda文件。我可以在这里找到开始使用的资源,...

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将未加引号的列名输入R函数[rpy2]

我想借助rpy2在Python中使用ICCest(R库ICC中的函数)。 R中ICCest的用法是ICCest(column_a,column_b,data)。但是,无法传递未引用的列...

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Docker中的R,Python,rpy2和drc软件包

[我正在尝试构建一个docker映像以执行一个python过程,该python进程从R调用(使用rpy2)软件包drc。

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在Rpy2中,Jupyter Notebook中在R单元中使用熊猫数据框时出现错误

我想在Jupyter Notebook中使用ggplot2。但是,当我尝试制作R魔术单元并引入变量时,出现错误。这是代码(一个段落表示一个单元格):import numpy ...

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Rpy2,pyrserve和PypeR的比较如何?

我想从Python程序中访问R。我知道Rpy2,pyrserve和PypeR。这三个选项的优缺点是什么?

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!pip install rpy2 == 2.3.0错误命令“ python setup.py egg_info”失败,错误代码为1

我运行以下代码!pip install rpy2 == 2.3.0错误,收到此错误命令“ python setup.py egg_info”失败,错误代码为1,位于C:\ Users \ ramic \ AppData \ Local \ Temp \ pip-install -...

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rpy2代码段返回一个空对象

我正在使用rpy2在Python中使用R库。该库具有函数prebas(),该函数返回一个数组,其中索引为[8]的项为输出。当我将此输出写入R中的CSV时...

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[rpy2在python中加载R-dataframe产生错误的时间戳记

我正在尝试使用rpy2将R数据帧加载到python中。将rpy2.robjects导入为robjects robjects.r ['load'](“〜/ example.Rdata”)这将生成一个python数据帧,其格式为:array(['times','all_data'],...

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如何将na_rm与rpy2 rlf.tapply函数一起使用

[我正在使用rpy2在Python中运行一段R代码,并尝试使用R中的tapply功能,如下所示:将rpy2.rlike.function作为rlf导入rpy2.robjects.packages作为rpackages minT = ...] >

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