rpy2 相关问题

RPy是R编程语言的一个非常简单但强大的Python接口。它可以管理各种R对象,并可以执行任意R函数(包括图形函数)。 R语言中的所有错误都将转换为Python异常。可以在Python中使用为R系统安装的任何模块

我正在努力从Python实现RTransferEntropy

[我已经在RStudio中编写了一个R脚本,用于计算x和y两个向量之间的传递熵,并希望从Python调用它并验证结果是否一致,以查看我是否...

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转换成数据帧大熊猫时保留ř数据帧索引值

使用R(基础版本3.5.2)包LME4,装混合效应模型经由rpy2 2.9.4在Python 3.6能够打印随机效应作为一个索引数据帧,其中,所述索引值的值运行...

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rpy2.rinterface.RRuntimeError:错误:.onLoad失败loadNamespace()为 'hdf5r'

我写了一个使用rpy2 python脚本(蟒蛇3.6)。 [R版本3.5.1是。当我运行importr(“修拉”),它给我的错误:/Users/kipnislab/anaconda3/envs/rmain/lib/python3.6/site-packages / ...

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只能在OSX上导入rpy2中的某些包,其他包含SIGSEGV错误

我最近从Windows切换到OSX。我有一些使用rpy2的脚本,我无法在OSX上工作,我不知道如何进一步解决问题。我见过其他几个......

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用rpy2在python中使用r clump

我的具体问题正是标题。我在python中有一个大型的光栅处理脚本,需要执行一个我在gdal / python中找不到的clump函数,也没想出如何'写...

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用rpy发送到X11的情节突然关闭?

我正在使用RPy2制作一些情节。该图显示但X11窗口立即消失。我输入的所有内容如下,其中CCFS是一个数据矩阵导入rpy2.robjects作为robjects r = ...

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从函数返回时rpy2错误 - RNULLType不可迭代

我很喜欢rpy2但是我从Rand Wilcox强大的统计数据包中找到了一个功能。出于某种原因,当我运行该函数时,我收到以下错误:TypeError:'rpy2.rinterface ....

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rpy2:在Python中表示NA作为R函数的参数

我试图将NA传递给R函数,例如,使用仅使用固定效果的lme4混合模型进行预测(即,没有随机效果):从rpy2.robjects导入rpy2.rinterface作为ri ....

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有没有办法从rpy2> = 3.0.0中的R向量,矩阵等返回名称

我想将命名为R向量(或矩阵等)的名称返回到Python中。在rpy2 <3.0.0中,这是可能的,例如,>>> stats.quantile(numpy.array([1,2,3,4]))R对象...

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rpy2 plot问题(设备没有响应)rpy2.rinterface.NULL

设置:1。win10,2。python3.5 / 3.6,3。R 3.42,4 4. rpy2 2.90或2.8x 5. Ipython 6.1.0当我使用rpy2作为rpy2文档时,绘图存在问题:在[ 26]:导入rpy2.robjects ......

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在conda环境中安装rpy2时出现DLL错误

我正在尝试安装我之前从conda环境导出的environment.yml文件。 yml文件指定对rpy2 = 2.8.6和r-base = 3.5.1的依赖关系。安装和......

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使用rpy2安装本地包 - 无效的包

我正在尝试运行本地r包并存储它返回的结果。我把R包放在与python脚本相同的目录中。我从rpy2.robjects.packages导入了importr并且...

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rpy2找不到包含目录

在使用命令:python setup.py build install安装rpy2软件包时,安装过程将引发以下错误。我已经配置了两个环境变量,指向丢失的文件....

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r_2的R_HOME错误

我知道有很多关于在Windows 7 32位上启动和运行rpy2的帖子。我引用了很多这些并尝试了他们的解决方案,包括使用PypeR。我不 ...

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从jupyter docker stack安装%dock的R cell magic in docker

我尝试从docker stacks安装datascience jupyter docker image(标签45b8529a6bfc,最后更新,2019年2月14日)。我的整个dockerfile:FROM jupyter / datascience-notebook:45b8529a6bfc USER $ ...

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使用多处理时,Python rpy2和matplotlib会发生冲突

我正在尝试使用多处理来计算和生成绘图。在Linux上,下面的代码运行正常,但在Mac(ML)上它没有运行,给出以下错误:import multiprocessing import ...

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在稀疏设计矩阵上运行带有rpy2的glmnet?

我有一个python片段,可以在np.array X和y上运行GLMNET。但是,当X是来自scipy的列稀疏矩阵时,代码失败,因为rpy2无法转换X.我是在制作...

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抑制rpy2中的警告

当我在python中导入R时,使用rpy2,如何禁止警告?看来在R中你只需要做以下选项(warn = -1)......但是我不熟悉R.我怎么在python中这样做?...

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如何使用rpy2使用for循环测试显着性?

我试图使用r(在rpy2包的帮助下)对来自pandas数据帧的一些变量进行t检验。我在jupyter笔记本中使用魔术函数让python与R.交互...

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将pandas数据推送到R时,使用rpy2防止R从单个pandas列生成多个列的最佳方法是什么?

我正在重新编码pandas df中的几列并将结果推送到R.问题是其中一个df列'temp_selection'在pandas df中只出现一次,但在R中多次出现。参见...

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