slurm 相关问题

SLURM是一个开源资源管理器，专为各种规模的Linux集群而设计。

如何解释sinfo --format“％O％e”输出上的CPU_LOAD和FREE_MEM

sinfo命令的CPU_LOAD（％O）和FREE_MEM（％e）--format参数的解释是什么？我有几个作业，它们的CPU_LOAD在0到25之间，这是我们的负载平均值...

slurm

回答 1 投票 0

如何在Slurm中安装python软件包/模块

这可能是一个非常基本的问题，但这是我第一次使用slurm-cluster，我不想弄乱任何东西（管理员正在休假）。我有一个使用“ ...

python cluster-computing slurm

回答 1 投票 0

slurm-并行运行多个R脚本

假设我有10个.R脚本（或任务），我希望使用HPC集群同时运行所有这些脚本。 HPC群集使用slurm作为批处理/排队系统，我知道要运行...

r parallel-processing batch-processing slurm

回答 2 投票 0

SLURM错误-sbatch HS8_main.sbatch sbatch：错误：无法打开文件HS8_main.sbatch

我正在尝试发送sbatch文件以在系统的200个内核中运行代码。我的代码是＃！/ bin / sh #SBATCH --job-name = sm＃职位名称#SBATCH --mail-type = ALL＃邮件事件（无，开始，结束，失败，全部）...

slurm sbatch

回答 1 投票 0

作业选项未定义提交的作业数

我用来触发snakemake的命令是：snakemake --snakefile Snakefile --configfile config.json --latency-wait 60 --rerun-incomplete --keep-going --notemp --reason --use-singularity --...

python slurm snakemake sbatch

回答 1 投票 0

R中并行函数中的多个数据帧

在R中，我在列表上调用parLapply（），并使用列表中的元素过滤函数中的2个数据帧，例如myfunction％filter（ID == id）b1＆...

r memory parallel-processing slurm

回答 1 投票 -1

输入在稀有作业中运行的奇异容器

我正在运行job_script.sh：＃！/ bin / bash奇异性--debug run --app $ {APP} \ --bind“ vol / on / host”：“ vol / on / container” \ $ {IMG_DIR} / ...

containers slurm singularity-container sbatch

回答 1 投票 1

从python评估“带有shell变量的Shell命令行”或将python字符串作为shell命令行评估

上下文我正在模拟集群上工作。为了尽可能地灵活（使用不同的模拟软件），我们创建了一个python文件，该文件解析定义...

python bash environment-variables pass-by-reference slurm

回答 2 投票 1

是否可以使用Slurm在chroot环境中运行用户的作业

我正在使用Slurm。我只希望用户访问自己的/ home /目录（或执行工作的目录），sudo用户安装的ubuntu软件包以及二进制文件user / bin，...

slurm chroot

回答 2 投票 4

如何使用Slurm进行交互式会话？

我发现了对srun --pty bash -i的引用（请参阅https://slurm.schedmd.com/faq.html#prompt），但是当我在群集上运行该引用时，它会立即退出。 $ srun –pty bash -i $ squeue JOBID ...

slurm

回答 1 投票 0

在群集服务器上以Slurm形式提交R作业，并将对象保存在与Slurm工作目录不同的目录中

我正在群集服务器上提交一个R作业，据我将结果保存到脚本文件所在的相同工作目录中看来，该作业正常运行。实际上，我想保存R中的结果（通过...

r cluster-computing slurm

回答 1 投票 2

我怎么知道通过SLURM提交的作业是否正在使用GPU？

[我怎么知道在SLURM中提交作业后，如果该作业正在使用GPU？

unix gpu cluster-computing slurm

回答 1 投票 0

我怎么知道通过SLURM提交的作业是否正在使用GPU？

[我怎么知道在SLURM中提交作业后，如果该作业正在使用GPU？

unix gpu cluster-computing slurm

回答 1 投票 0

在SLURM中运行二进制文件

我曾尝试使用“ --wrap”在SLURM中运行二进制的“ rafb”，就像sbatch --wrap rafb一样，但它显示的是sbatch：错误：--wrap选项不允许使用脚本参数。没有这个“ --...

bash slurm

回答 1 投票 1

sendmail在Slurm Workload Manager中不起作用（通过命令行工作）

我在从Slurm Workload Manager发送电子邮件时遇到问题。我是特权有限的普通用户。当我使用SSH进入远程服务器时，我能够从命令行sendmail user @ ...]发送电子邮件。

email server sendmail slurm

回答 1 投票 2

MPI结果在Slurm和使用命令时有所不同

当我运行Slurm的MPI项目时遇到了一个问题。 a1是我的可执行文件。当我只运行mpiexec -np 4 ./a1时，它运行良好，但是在Slurm下运行它时，它运行不正常，看起来像是它...

c++ mpi slurm

回答 1 投票 0

如何用Slurm为计算树建模？

我有一个由N个步骤组成的模拟，按顺序运行。这些步骤中的每一个都会修改内存中的全局状态，直到最后一个步骤即为结果。在运行步骤之后，...

slurm

回答 2 投票 0

由Slurm作业启动的所有进程是否在取消作业时就被杀死？

如果Slurm作业启动了进程（甚至可能是守护进程），如果我用scancel停止该作业，所有进程都会被自动杀死吗？

linux slurm

回答 1 投票 0

无法在同一台计算机上的Ubuntu 18.04上使用SLURM运行并行作业

似乎我无法在同一节点上运行并行作业。我已经在一台机器上设置了SLURM（Ubuntu 18.04 CPUs = 8 Boards = 1 SocketsPerBoard = 1 CoresPerSocket = 4 ThreadsPerCore = 2 RealMemory = 15976），可与...一起使用...

slurm

回答 1 投票 0

传递字符串参数以在SLURM中命名作业

我想将参数传递给集群中的bash脚本，以便命名作业。我试过这个：＃！/ bin / bash #SBATCH -J“ $ 1”＃

linux cluster-computing slurm

回答 1 投票 0

slurm 相关问题

最新问题