survival-analysis 相关问题

生存分析是对事件数据的审查时间的统计,由于观察的不确定组成员资格,标准回归和分类技术通常不适用于此。该名称源于生物系统,其中感兴趣的结果确实存在或死亡,但该概念同样适用于机械故障,经济事件或其他类型的预测。

如何合并两个生存图

我使用 ggsurvplot 和 ggplot 创建了两个图。下面是我尝试过的代码 p1 <- ggsurvplot(KM_new, data = data_log, time = "log_time", conf.int = FALSE) p2 <- ggplot(data, aes...

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如何从survfit对象中提取值

我创建了这个模型: 型号 <- survfit(Surv(time,status)~c$sex) model and the output is: Call: survfit(formula = Surv(time, status) ~ c$sex) records n.max n.start events medi...

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增加显示的小数位数

当我通过 R 进行任何数据分析时,我只得到整数的返回。有没有办法获得更准确的估计,例如小数点后两位。 例如: survfit(Surv(数据$TTE...

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在同一张图上绘制两个不同模型的生存曲线,在 R 中

我正在使用两个不同的二元分类模型,每个模型都有不同数量的测试样本(有一些相互样本)。这些模型的预测分数用于...

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在 R 中绘制对数累积危害图

我正在尝试生成对数累积危害图,作为 PH 假设评估的一部分。这是我生成情节的代码: 图书馆(生存) # 加载肺癌生存数据 肺&l...

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解释考克斯回归结果[关闭]

在这里输入图片描述 我需要一些帮助来解释结果: emp_pos_increase 变量中的两组(是,否)和参考组是否 lob_code 变量中的两组 (PHY,UCC) 和

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R 中的亚组分析

我正在尝试使用 CPH 回归在 R 中进行子组分析。我基本上有很多患有糖尿病 (Y/N) 和一定尿量 (>/<200ml). Looking to gauge the

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R 中的亚组分析

我正在尝试使用 CPH 回归在 R 中进行子组分析。我基本上有很多患有糖尿病 (Y/N) 和一定尿量 (>/<200ml). Looking to gauge the

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是否有用于对数逻辑分布的安德森达林测试的 R 代码?

我想测试数据是否来自逻辑分布,使用 Anderson Darling 测试 我尝试过使用各种库的 ad.test() 但我没有得到任何结果。

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最初在 Stata 中生成的生存分析结果在 R 中的再现有问题吗?

我正在尝试重现发表在期刊上的一些生存分析结果。原始结果是在 Stata 中生成的。这是代码: *政变 gen c_coup=c 如果退出则替换 c_coup=0!="

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使用 scikit-survival 评估单个 GridSearchCV 中的多个指标

目前,我正在做一个模拟来比较多个模型,我的研究不需要 best_estimator_ 只需要来自 cv_results_ 的结果。我遇到的问题是我需要

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我可以在 XGBSE 模块使用区间删失数据吗?

在使用 xgboost/aft 的生存分析中,区间截尾数据可以应用于输入形式,如 ['下限时间', '上限时间'],其中 np.inf 也可以用作 '上限时间' 值...

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循环/迭代 R 中的许多列以进行 Cox 比例风险回归

我有大量事件要分析,所有事件都在单独的列中,如下面的示例所示。我想通过 FOR 循环在 R 中为每个标记为 IDXX 的列创建一个模型。 然而,...

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如何将这个 cv.glmnet 包装成一个函数?

这是基本代码,鉴于我拥有的基因集,我需要运行很多次。 x<-as.matrix(pca_matrix1) y <- Surv(surv_obj1$OS_MONTHS,surv_obj1$Status) set.seed(02042019) ...

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flexsurv中的自定义生存功能

我想在 flexsurv 包中实现自定义生存函数,类似于第 4 节(第 12 页): https://cran.r-project.org/web/packages/flexsurv/vignettes/flexsurv.pdf 说我有一个

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在 ggsurvplot() 中自定义标题和 p 值的位置

我无法像在 Pvalue 的情况下那样将标题的位置削减到右上角。 以下代码: ggsurvplot(fit, # survfit object with calculated statistics d...

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R 中参数化生存模型的校准斜率

我有两个用于weibul分布参数生存分析的数据集:一个用于训练,另一个用于测试。 我想评估测试数据集中的校准。 我试过 rms 包,但我

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在 r

我正在尝试计算我的数据集中每年出现的人数,从最近一年开始。我的数据集看起来像这样: ID 年级 学年 1个 9 “17-18&...

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如何从 contsurvplot 包中叠加两个 ggplot2 对象?

我有两个图是从 constsurvplot 包的 plot_surv_at_t 生成的。一个是观察 5 年无复发生存率与肿瘤大小的关系。另一种是癌症特异性的...

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用 95%CI 估计累积发生率、累积发生率和累积发生率差异的 R 代码是什么

我想根据生存率估计特定时间点(0、12、24、36、48、60 个月)的累积发病概率、累积发病率和累积发病率差异与 95%CI...

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