素食主义者是与R一起用于分析生态群落，特别是植被群落的一揽子计划。它具有分析生态多样性和社区多变量分析的工具（NMDS，pCCA，pRDA等）
如何自定义 estaccumR 对象的绘图，以便只有 S 和 Chao（而不是 ACE）叠加在单个双图中？使用基本 R 和 ggplot 的描述值得赞赏。 es 的示例...
如何在 vegan (r) 中的 adipart/oecosimu 对象中索引置信区间（2.5% 和 97.5%）？
我正在使用 r 中 vegan 包中的 adipart() 函数运行加性多样性分区模型。从生成的 adipart 对象中，我想将 2.5% 和 97.5% 列索引为 vec...
R 中的 RDA - 图中站点的标签名称中有 row1、row2、row3...等，而不仅仅是 1、2、3
所以我尝试使用 RDA 和 vegan 包在 R 中绘制物种、地点和环境数据。在我的 RDA R 中，自动将站点分数表中的站点命名为 row1、row2...等。我可以更改...
我正在使用 vegan 包中的 adonis2 运行 PERMANOVA。我在 4 个研究区域内有 52 个植被样地。我对保护区、火灾和熊的存在如何影响这些植被感兴趣
我正在尝试将 envfit 添加到我在 ggplot 中制作的 NMDS 图中，我遇到了与此处箭头太小的帖子相同的问题（我想对帖子发表评论，但我没有足够的
这道题涉及多元生态学，将以Site x Species矩阵为例。总的来说，这个问题寻找的是删除数据框中某些数据的方法。我们有5个专...
我对 R 和素食主义者很陌生，所以我希望这不是一个愚蠢的问题。我有一个非常大的数据集（516 个条目，330 列）。我一直在 Vegan 中运行 Decorana，并且想访问轴
如何在 Rmarkdown 中将 NMDS 输出和 betadisperser 输出格式化为 HTML
我想将输出格式化为 rmarkdown 中看起来正确的表格，并使用 HTML 作为输出。 我在格式化由纵坐标函数产生的输出对象时遇到问题 nmds.布雷<- ordinate(...
如何使用 R 中的 adonis2 为不平衡研究设计指定正确的排列结构？
我有来自两年、三个地区和两个行为组的动物受试者样本。 数据都是观察性的，研究的设计很不平衡。 我想知道是否
如何在 R 中的 vegan 包中编写 decostand 函数循环？
我想循环 vegan 包中的函数 decostand 超过 72 行，放入 10 个种子中。 1.Dataframe 包含 72 行，包含物种和环境 x 10 次运行（或种子）。 #创建数据框`df ...
如何在 PCoA 中为包含混合/有序变量的相异矩阵指定特征向量？
我有一个包含许多物种的序数变量的数据集，我想使用主坐标分析 (PCoA) 将其可视化。当我认为数据是连续的（numeri ...
在 Vegan-package 中指定 adonis2 的受限排列
类似的问题之前有人提出过，但是我没能正确理解如何将其应用到我的实验设计中。 实验设计： 9 个块数不平衡 och 图...
核心问题：对于"'qr'和'y'的行数必须相同 "可以做哪些调试 我正在运行一个RDA，之前已经做了几十次了。这次唯一不同的是我使用了......。
我想用R素包中的metaMDS函数 对一些数据进行NMDS分析。我已经设法用类似的数据框架运行它，但由于某些原因，我得到了以下错误......
我正在努力完成一个我在vegan和ggplot2中创建的NMDS图，但我想不出如何将envfit物种加载向量添加到图中。当我尝试添加时，它说 "无效的图形状态"。...
decorana(df)中的错误：社区矩阵中所有行的总和必须是>0删除空站点。素食主义者的DCA
我试图在Vegan中运行PCA受到马蹄效应后的DCA，然而，我得到了以下错误代码。decorana(df)中的错误：所有行的总和必须是>0，在社区... ...
我有20个长度不同的数据帧，但是列数都相同。我想对每个数据帧进行一些分析，在这种情况下使用素食主义者进行距离矩阵分析。我有...
我正在尝试创建一个将其他两个函数复制100倍的函数，然后计算这些值的平均值。我有一个像这样的矩阵：str（pref）#num [1：9，1：158] 4 9 15 6 7 8 ...
我正在寻找一个清晰的解释，说明如何正确解释NMDS图上的排序椭圆，以及该解释如何随用户选择的不同置信度和椭圆'... >>>>