Rscript安装程序包：如何使它失败并显示错误代码？

Question

我正在用R构建docker容器，其行类似：

RUN Rscript -e 'install.packages("tidyverse", "text2vec")'

但是，如果安装其中一个软件包失败，甚至认为已记录“ ...具有非零退出状态”，则docker构建将继续进行。

如果install.packages安装其中一个软件包时出错，如何使Rscript失败并显示错误代码？

Answer 1

您可以在调用install.packages之后，在下面创建R脚本（myScript.R）以测试您的任何软件包在调用库函数时是否出错。如果是，则程序退出并显示错误代码。

#!/usr/bin/env Rscript

packages = commandArgs(trailingOnly=TRUE)

for (l in packages) {

    install.packages(l, dependencies=TRUE, repos='https://cran.rstudio.com/');

    if ( ! library(l, character.only=TRUE, logical.return=TRUE) ) {
        quit(status=1, save='no')
    }
}

用于使用Docker测试脚本：

ADD myScript.R /

RUN Rscript myScript.R tidyverse text2vec

此答案是从这里（how do I make install.packages return an error if an R package cannot be installed?）获得的。解决了安装软件包失败时返回错误的相同问题，但没有docker。

另一个可能的解决方案是使用installed.packages，以测试您的软件包是否已成功安装。