在Bio.Enter（BioPython）中将e-utils命令转换为等效命令

Question

我在使用BioPython连接每个命令时遇到了一些麻烦。

有人可以帮助我使用BioPython将此命令行转换为等效命令行吗？

esearch -db assembly -query "GCF_002514765.1" | elink -target biosample | efetch -format xml

谢谢，

Answer 1

Esummary可以解决它。

from Bio import Entrez

acc = "GCF_002514765.1"
search = Entrez.read(Entrez.esearch(db="assembly", term=acc))
summary = Entrez.read(Entrez.esummary(db="assembly",id=idsearch['IdList'],report="full"))