将每个因素水平作为虚拟变量输出到观星台汇总统计表中。

问题描述 投票:5回答:3

我使用的是R包 观星者 来创建高质量的回归表,我想用它来创建一个汇总统计表。 我的数据中有一个因子变量,我想让汇总表向我展示因子在每个类别中的百分比--实际上,将因子分离成一组相互排斥的逻辑(虚拟)变量,然后将这些变量显示在表中。 这是一个例子。

> library(car)
> library(stargazer)
> data(Blackmore)
> stargazer(Blackmore[, c("age", "exercise", "group")], type = "text")

==========================================
Statistic  N   Mean  St. Dev.  Min   Max  
------------------------------------------
age       945 11.442  2.766   8.000 17.920
exercise  945 2.531   3.495   0.000 29.960
------------------------------------------

但我想得到一个额外的行 来显示每组的百分比(在这些数据中,对照组和病人的百分比)。 我确信这只是stargazer中的一个选项,但我找不到它。 有人知道这是什么吗?

编辑。car::Blackmoor 已更新拼写为 car::Blackmore.

r regression stargazer
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由于Stargazer不能直接做到这一点,你可以创建你自己的汇总表作为一个数据框架,并使用pander,xtable,或任何其他包输出。例如,下面是如何使用dplyr和tidyr来创建一个汇总表。

library(dplyr)
library(tidyr)

fancy.summary <- Blackmoor %>%
  select(-subject) %>%  # Remove the subject column
  group_by(group) %>%  # Group by patient and control
  summarise_each(funs(mean, sd, min, max, length)) %>%  # Calculate summary statistics for each group
  mutate(prop = age_length / sum(age_length)) %>%  # Calculate proportion
  gather(variable, value, -group, -prop) %>%  # Convert to long
  separate(variable, c("variable", "statistic")) %>%  # Split variable column
  mutate(statistic = ifelse(statistic == "length", "n", statistic)) %>%
  spread(statistic, value) %>%  # Make the statistics be actual columns
  select(group, variable, n, mean, sd, min, max, prop)  # Reorder columns

如果你用pander的话,结果是这样的:

library(pander)

pandoc.table(fancy.summary)

------------------------------------------------------
 group   variable   n   mean   sd    min   max   prop 
------- ---------- --- ------ ----- ----- ----- ------
control    age     359 11.26  2.698   8   17.92 0.3799

control  exercise  359 1.641  1.813   0   11.54 0.3799

patient    age     586 11.55  2.802   8   17.92 0.6201

patient  exercise  586 3.076  4.113   0   29.96 0.6201
------------------------------------------------------

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另一个变通的方法是使用 model.matrix 在一个单独的步骤中创建虚拟变量,然后使用 stargazer 以此创建一个表。 要用这个例子来说明。

> library(car)
> library(stargazer)
> data(Blackmore)
> 
> options(na.action = "na.pass")  # so that we keep missing values in the data
> X <- model.matrix(~ age + exercise + group - 1, data = Blackmore)
> X.df <- data.frame(X)  # stargazer only does summary tables of data.frame objects
> names(X) <- colnames(X)
> stargazer(X.df, type = "text")

=============================================
Statistic     N   Mean  St. Dev.  Min   Max  
---------------------------------------------
age          945 11.442  2.766   8.000 17.920
exercise     945 2.531   3.495   0.000 29.960
groupcontrol 945 0.380   0.486     0     1   
grouppatient 945 0.620   0.486     0     1   
---------------------------------------------

编辑: car::Blackmoor 已更新拼写为 car::Blackmore.


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该包 tables 对这个任务很有用。

library(car)
library(tables)
data(Blackmore)

# percent only:
(x <- tabular((Factor(group, "") ) ~ (Pct=Percent()) * Format(digits=4), 
    data=Blackmore))
##              
##         Pct  
## control 37.99
## patient 62.01

# percent and counts:
(x <- tabular((Factor(group, "") ) ~ ((n=1) + (Pct=Percent())) * Format(digits=4), 
    data=Blackmore))
##                      
##         n      Pct   
## control 359.00  37.99
## patient 586.00  62.01

然后直接将其输出为LaTeX。

> latex(x)
\begin{tabular}{lcc}
\hline
  & n & \multicolumn{1}{c}{Pct} \\ 
\hline
control  & $359.00$ & $\phantom{0}37.99$ \\
patient  & $586.00$ & $\phantom{0}62.01$ \\
\hline 
\end{tabular}
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