Can't install mpi4py with OpenMPI: Cannot compile MPI programs

Question

这是我在这里的第一篇文章，如果我的风格有误，请见谅！

我一直在尝试使用 python 3.6 在 Ubuntu 16.04 上安装 mpi4py（因为 SU2 需要它进行并行处理）。我下载了 mpi4py 并尝试从源代码构建，因为我想使用我配置的 OpenMPI 库，并尝试了以下操作：

sudo python setup.py build --mpicc=/opt/openmpi/openmpi-2.1.0/bin/mpicc

但是，它最终失败并显示“错误：无法链接 MPI 程序。检查您的配置！！！”

查看 SU2 和 mpi4py 文档，他们建议改用 pip。我也试过这个：

sudo pip install mpi4py

和

env MPICC=/opt/openmpi/openmpi-2.1.0/bin/mpicc pip install mpi4py

但他们也给出了同样的错误。

我已经保存了两个输出 - 请查看附件的链接。它似乎从我的 NVIDIA CUDA 安装中获取了很多文件，但我不确定为什么。

我是编译程序的初学者，所以如果有人能对此有所了解，我将不胜感激？谢谢。

Answer 1

虽然这是一篇旧帖子，但我会发布我的答案可能对其他人有帮助。

我通过以下命令解决了这个问题：

sudo apt install libopenmpi-dev
 
pip install mpi4py` 

Answer 2

对于正在为这个问题而苦苦挣扎的其他人来说，事实证明这是多种因素造成的。主要是，mpi4py 没有正确构建，因为我的 MPI (openMPI) 实现没有正确构建。在现有的超级计算机和全新的 Linux 安装上构建程序有很多不同的因素。

我可以推荐的一些故障排除技巧是：

1. 确保使用

   unset

清除所有不需要的环境变量

2. 使用

   module unload

   卸载任何可能干扰安装的模块。在已经加载了多个其他计算机的超级计算机上构建您自己的 MPI 实现时尤其如此。

3. 检查您的

   $PATH

   变量是否有可能污染您的安装的任何位置（不要忘记顺序很重要）！您可能需要临时设置一个更清晰的 PATH 变量，以确保构建选择正确的库。

希望这有帮助。