Snakemake：是否可以只使用--dryrun显示“作业计数”？

Question

如何让Snakemake在干跑时只显示Job counts字段？执行实际运行时，这是Snakemake在启动作业之前输出的第一个信息。

目前，我获得工作的方式是在没有-n标志的情况下运行Snakemake并立即取消它（^C），但这远非理想。

让干运行完成将在最后输出Job counts，但这对于拥有数百或数千个工作的管道来说是不可行的。

期望的输出：

$ snakemake -n --someflag
Job counts:
        count   jobs
        504     BMO
        1       all
        504     fit_nbinoms
        517     motifs_in_peaks
        503     motifs_outside_peaks
        2029
$

Answer 1

Flag -q这样做。

--quiet, -q    Do not output any progress or rule information.