如何使用qalter清除PBS作业依赖？

Question

假设我使用qsub -W depend=afterok:JOBID向集群发送了一个具有依赖关系的作业，如何使用qalter命令清除它（使用PBSpro调度程序）？我在qalter man page中找到了一些信息，但是找不到如何清除它，只是如何创建一个新的依赖项。

Answer 1

在一些朋友的帮助下我得到了一个答案，显然我必须提交一个qalter命令来改变依赖，但不是指定一个新的JOBID，只是省略:JOBID。

例：

提交一份取决于成功完成上一份工作的工作（比如1234）

qsub -q my_queue -l ... -W depend=afterok:1234 file.pbs

新提交的工作将保持暂停，直到工作1234完成与ExitStatus:0。我们可以使用qstat命令检查新提交的作业的JobId和状态（其状态应该是H代表Hold并说它的Id是1235）。然后，如果我们决定不需要等待第一个命令完成，我们可以清除依赖关系：

qalter -W depend=afterok 1235

请注意，我在afterok之后省略了冒号和依赖关系Id，并且qalter要求JobId将其更改为最后一个参数。