Snakemake 的 Slurm 配置文件对 Snakamake 版本来说是一个魅力< 8.0. It stoped working since there are few 大的改变和重命名。 具体来说,较新的版本似乎没有检测到标志
cluster-sidecar
、cluster-cancel
、cluster
和 cluster-status
。不幸的是,这与 Snakemake 的文档发生冲突。
有人可以向我指出新文档或如何避免这些错误/重命名标志吗?我尝试运行我的代码(在 7.32.4 版本中完美运行),但遇到了无法识别标志的 Snakemake 问题。
snakemake-executor-plugin-cluster-generic 进行集群执行。
可以在此处找到描述新标志的文档:https://snakemake.github.io/snakemake-plugin-catalog/plugins/executor/cluster-generic.html