如何使用Python根据日期和术语从Pubmed检索信息？

Question

[您能否告诉我如何从PubMed中获取5篇包含“肥胖”一词的最新文章，并使用Python返回每篇论文的作者，标题，日期，doi和PubMed PMID？预先谢谢你

编辑：

我到目前为止的尝试。我相信这是想要的结果，但我需要获取正确的发布ID才能运行该功能

from Bio.Entrez import efetch
from Bio import Entrez
Entrez.email = '[email protected]'

def print_abstract(pmid):
    handle = efetch(db='pubmed', id=pmid, retmode='text', rettype='abstract')
    print(handle.read())

print_abstract(pmid)

Answer 1

您可以使用esearch中的esearch函数查找与查询匹配的最新PubMed条目的UID：

Bio.Entrez

通过指定

handle = Entrez.esearch(db="pubmed", term="obesity", retmax=5)
results = Entrez.read(handle)                                                   
print(results["IdList"])

，您可以提供查询字符串-从您的问题中查找与“肥胖”相关的条目。 term允许我们配置应返回多少UID（默认为20）。

现在运行此命令时，我得到以下UID：

retmax

在撰写本文时，它们对应于您手动执行PubMed搜索时的最新条目UID。它们按照最新的条目排序。

使用这些UID，您的['32171135', '32171042', '32170999', '32170940', '32170929'] 函数将按预期执行。