想知道是否有很好的示例或建议来说明如何处理基于数据库的科学数据管道(数据联合)中需要手动审核的步骤。例如,我们希望通过自动化管道处理神经元钙成像数据的预处理和去噪/分离,但每个视频和每个细胞在输入数据库进行进一步分析之前都需要手动审查。处理这些步骤的最佳实践是什么?添加手动表以仅添加通过下游管道阶段审核的数据?将手动审核之前的步骤与管道的其余部分分开(在它们自己的模式中?)?谢谢!
首先,您可以调用交互式 GUI 作为需要手动干预的特定表的
make
方法的一部分。它将呈现计算结果以供人工审查/管理/纠正。
其次,您可以定义手动表来支持手动审核/管理。例如,钙成像元素中的
Curation
表遵循以下模式:https://github.com/datajoint/element-calcium-imaging