从python评估“带有shell变量的Shell命令行”或将python字符串作为shell命令行评估

Question

上下文

我正在研究模拟集群。为了尽可能地灵活（使用不同的模拟软件），我们创建了一个python文件，该文件解析定义环境变量的配置文件，并创建了命令行以启动模拟。通过SLURM sbatch命令（shell $ COMMAND）启动此命令]

问题

[从python开始，所有环境变量都已注册以读取配置文件我在使用其他环境变量（显示为shell变量）的变量COMMAND中遇到问题]

例如

COMMAND = "fluent -3ddp -n$NUMPROCS -hosts=./hosts -file $JOBFILE"    
os.environ['COMMAND']=COMMAND    
NUMPROCS = "32"    
os.environ['NUMPROCS']=NUMPROCS    
[...]    
exe = Popen(['sbatch','template_document.sbatch'], stdout=PIPE, stderr=PIPE)

分批将COMMAND作为COMMAND作为命令行分发给所有模拟节点

COMMAND调用其他保存的环境。变量。 Shell严格将其解释为文本...这使命令行失败。严格来说，它是使用$ not变量的字符串，例如：'fluent -3ddp -n$NUMPROCS -hosts=./hosts -file $JOBFILE'

我正在寻找的解决方案

我正在寻找一个简单的解决方案解决方案1：1到3条python命令行将COMMAND评估为要回显的shell命令解决方案2：使用Shell命令将“字符串” $ COMMAND中的变量评估为变量最后，从sbatch内部启动的命令应为

fluent -3ddp -n32 -hosts=./hosts -file /path/to/JOBFILE

Answer 1

似乎我对这个问题的解释不够好，但是您的第三个解决方案似乎符合我的期望……尽管到目前为止我没有设法适应它。

根据您的第三个解决方案BASH，我将使其更加简单：假设我在运行python之后得到了关注，并且无法修改]

EXPORT COMMAND='fluent -3ddp -n$NUMPROCS -hosts=./hosts -file $JOBFILE'
EXPORT JOBFILE='/path/to/jobfile'
EXPORT NUMPROCS='32'
EXPORT WHATSOEVER='SPECIFIC VARIABLE TO SIMULATION SOFTWARE'

我希望使用$ COMMAND / $ JOBFILE / $ NUMPROCS从Slurm批处理文件（bash）中执行以下操作>

fluent -3ddp -n32-hosts=./hosts -file /path/to/jobfile
[请注意：我在python中有备用解决方案-我设法用$ VARIABLE的值替换了它-根据假设$ VARIABLE不是由另一个$ variable组成的...使用正则表达式替换...只是看起来这么多行对我来说有简单的要求

Answer 2

您有几种选择：