如何在pca2d中更改轴尺寸？

Question

我正在使用pca3d包来绘制基因表达数据的主要组成部分1-5。我很难标准化3d绘图，所以相反我绘制了PC1与PC2，PC2与PC3等。我的代码如下

par(mfrow = c(2,2))
for(n in 1:4){

  pca2d(pcaSix$x[,n:(n+1)], # Mclust Grouping - module Genes
        title = "Six Genes From Abel, et al. 2011",
        shape = 16,
        group = clustersMod1six,
        radius = 1,
        legend = NULL,
        show.centroids = FALSE,
        show.ellipses = TRUE,
        col = ClusterColorsSix,
        axe.titles = c(paste("PCA",
                             n,
                             sep = ""),
                       paste("PCA",
                             n+1,
                             sep = "")
                       ),
        xlim = c(-1,1),
        ylim = c(-1,1)
        ) 

}

我遇到的问题是xlim和ylim论证似乎没有对情节有任何影响，我发现this post建议使用asp参数，但设置asp不允许我改变轴。

有谁知道我怎么能强迫pca2d改变轴限制？

Answer 1

在不修改功能的情况下，无法控制轴。见line 32：

plot(NULL, type= "n", 
  xlim= prange$x,
  ylim= prange$y,
  xlab= xlab,
  ylab= ylab,
  bty= "none"
  )