R：来自pROC包的AUC

Question

我最近遇到了pROC包来获得AUC。在帮助部分中，他们给出以下示例：

library("pROC")
data(aSAH)
auc(aSAH$outcome, aSAH$s100b)

在上面，outcome是factor而s100b是numerical。

我的问题是AUC在这种情况下是如何工作的？它适用于s100b的门槛是多少？或者没关系？

编辑1上面的代码导致AUC = 0.73。我如何知道选择哪个阈值来获得此值？

Answer 1

pROC的auc函数中的AUC是ROC curve下的面积。在幕后，该函数首先调用roc函数，所以你所做的相当于：

myroc <- roc(aSAH$outcome, aSAH$s100b)
auc(myroc)

通过计算所有可能阈值的灵敏度和特异性来获得ROC曲线。您可以使用plot函数显示曲线，AUC显示为灰色：

plot(myroc, auc.polygon=TRUE)