.libPaths() 渲染 .qmd 时顺序发生变化

Question

我尝试渲染一个 qmd，其中使用了我手动更新的包，该包也是由已安装的 R 映像提供的。

在我的 R 设置中，包位于 3 个不同的目录中。一种带有基础 R，一种带有 R 映像中包含的软件包，一种带有手动安装的软件包。当手动安装 R 映像中提供的较新版本的软件包时，加载它们通常会导致加载手动安装，因为相应的目录是

.libPaths()

中的第一个条目。然而，在渲染 qmd 时，库搜索路径顺序似乎混淆了，我最终得到了 R 图像中较旧的包版本，因为它们是最先找到的。

重现：

1. 您需要类似的设置，其中最新版本的

   readr

   位于

   .libPaths()

   列出的第一个目录中，旧版本的

   readr

   位于搜索顺序较低的库路径中。

2. 在 qmd 文件中运行以下代码，然后渲染它。

---
title: "library_paths_example"
format: html
editor: visual
---

```{r}
packageVersion("readr")
.libPaths()
```

您应该看到 qmd 内的输出和渲染的 html 中的顺序和包版本不同。我不确定是什么导致库搜索路径重新排序，但我想如果它不能立即工作，您可能需要尝试一下路径目录命名。

Answer 1

作为解决方法，可以在调用

library()

时通过设置参数

lib.loc = path

来传递库路径，即

library(readr, lib.loc = path)

。