Pandas数据透视表显示“ FutureWarning：排序，因为未连接的轴未对齐”

Question

我有以下DataFrame：

df = pd.DataFrame({'category':['A', 'B', 'C', 'C'], 
                   'bar':[2, 5, float('nan'), float('nan')]})

然后我只有一行代码，在这里我试图在DataFrame的一列上应用两个聚合函数，并按另一列中的值分组：

df.pivot_table('bar', 'category', aggfunc=['median', 'count'])

由于某种原因，它给我以下警告：

FutureWarning：排序，因为非并置轴未对齐。熊猫的未来版本将更改为默认情况下不排序。至接受将来的行为，传递“ sort = False”。保留当前行为并取消警告，通过'sort = True'。

据我对这个警告的了解，它涉及“ concat（）”或“ append（）”方法。我没有调用这两个方法，因此我只能假定在“ pivot_table（）”方法内部的某个位置隐式使用了两者之一。我很乐意通过“ sort”参数来使警告静音，但是如果隐式调用该方法，我看不到这样做的方法。

我在此示例上进行了一些测试，看起来警告仅在满足以下所有三个条件时才会出现：

1）汇总的值中至少有一组完全由缺失值组成；

2）至少有两个聚合函数；

3）聚合函数之一是“ count（）”。

目前，我的工作原理是，两个聚合函数在生成的数据透视表应具有多少行上无法达成共识。 “ count（）”函数在所有由完全缺失的值组成的组中放入零。但是其他函数完全忽略了此类组，因此当不存在“ count（）”时，数据透视表中仅会缺少相应的行。但是，如果存在“ count（）”，它将强制其他函数不要忽略这些组，并在各个单元格中创建NaN值。

此结果对我来说很好，我可以使用它，但我不喜欢无人看管警告。关于该怎么办的想法？

Answer 1

我能够在大熊猫0.25.1上复制该问题，此减弱与pandas.core.reshape.pivot.py有关，其中包括以下语句

# line 56
return concat(pieces, keys=keys, axis=1)

此concat发出警告，pieces是数据帧的列表，其中各列与参数aggfunc的每个函数相关，将发生以下情况：

pieces[0]
#           bar
# category     
# A         2.0
# B         5.0

pieces[1]
#           bar
# category     
# A           1
# B           1
# C           0

由于pieces[0]和pieces[1]具有不同的索引，所以熊猫需要对数据帧进行排序以在值之间进行匹配。

1.0.1中不会发生此问题。如果您不希望显示警告，请添加参数dropna=False，以便NaN列都包含在aggfunction中。

df.pivot_table('bar', 'category', aggfunc=['median', 'count'], dropna=False)

[请注意，有些函子不能与nan值一起使用，numpy包含处理nan和np.nanmedian之类的许多处理np.nanmedian的函数，请考虑将其检出。