无法从 Matlab v7 读取 R 中的 hdf5 文件

Question

我正在尝试从 matlab v7 读取 .mat 文件。

我尝试了以下代码，期望 lapply 为 mydata 分配一个包含每个文件中的数据的列表。

> library(rhdf5)
> base :: setwd('filepath')
> filenames <- base::list.files(
>    path = ('filepath'), 
>    recursive = TRUE,
>    pattern = "*.mat"
> )
> mydata <- lapply(filenames, function(x) h5read(x))

相反，我收到了以下代码：

> Error in H5Fopen(file, flags = flags, fapl = fapl, native = native) : 
> HDF5. File accessibilty. Unable to open file.

我也查看了Bioconducter网站，但我只能找到下载数据的解决方案，而不是本地存储的数据。

Answer 1

我能够通过使用另一个名为 raveio 的包来解决这个问题。发布作为答案，以防其他人遇到类似问题！

library(raveio)
base :: setwd("filepath")
filenames <- base::list.files(
  path = ("fiepath"), # Insert your relevant filepath here
  recursive = TRUE,
  pattern = "*.mat"
)