如何从几个新的bam文件中获取SNV基因型数据?

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我有几个SNV,例如:

#CHROM  POS ID REF ALT
chr1   1000  .   A   C
chr1   2000  .   T   A

我可以从几个新的 bam 文件中获取他们的基因型数据(REF 覆盖率、ALT 覆盖率)吗?例如:

tumor1.bam
tumor2.bam

我期待这样的结果:

##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
##FORMAT=<ID=DR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference reads">
##FORMAT=<ID=DV,Number=1,Type=Integer,Description="Number of variant reads">
#CHROM  POS ID REF ALT  FORMAT   tumor1.bam tumor2.bam
chr1   1000  .   A   C  GT:DR:DV  0/1:20:10   0/1:30:5
chr1   2000  .   T   A  GT:DR:DV  0/1:80:10   0/1:20:8

有什么建议吗?

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