有没有办法根据R中列中的多个值来过滤行？

Question

我有一个像这样的 tsv 文件。

读取ID	V_段
abc	IGHV3-18-F(2695)
定义	IGHV3-9-F(2714),IGHV3-12-F(2656)
吉	IGHV3-9-F(2840)
jkl	IGHV3-10-F(2666),IGHV3-18-F(2666)

使用 R，我需要过滤，一方面，那些包含“V_segment”列中的值的行，另一方面，那些包含“V_segment”列中的两个或多个值的行（用逗号分隔的值） ）。并创建两个表，其中一个表的行在“V_segment”列中具有一个值，而其他表则包含其他行。

我到现在为止写的代码是：

df <- read_tsv('alignments.tsv')
alignments_v <- data.frame(df$readId, df$V_segment,
                           stringsAsFactors = FALSE)
x <- alignments_v %>% separate(df.V_segment, c('V segment', 'Combinations V segment'), sep = ',')

但是我没有得到我需要的东西......

你能帮我吗？

提前谢谢您！

Answer 1

在基本 R 中，您可以使用

grepl

来过滤分隔多个条目的逗号：

V_one <- df[!grepl("\\,", df$V_segment),]
#   readId        V_segment
# 1    abc IGHV3-18-F(2695)
# 3    ghi  IGHV3-9-F(2840)

V_twoplus <- df[grepl("\\,", df$V_segment),]
#   readId                         V_segment
# 2    def  IGHV3-9-F(2714),IGHV3-12-F(2656)
# 4    jkl IGHV3-10-F(2666),IGHV3-18-F(2666)