如何从Python中执行的R脚本返回多个对象

Question

所以我很难使用rpy2包来集成R和Python之间的一些工作流程。

例如，想象一下我正在尝试运行一个在R中执行线性回归的Python脚本，我想要返回其中的所有元素（实际上我正在尝试做一些比这更复杂的事情）。

我在Python中执行以下命令（调用R;这假设你安装了rpy2）：

import rpy2.robjects as ro
test = ro.r('''
            # Load in data
            df <- mtcars
            # Run regression
            out = lm(formula='mpg ~ cyl + hp + wt',data=df)
            ''')

而现在呢？我有一个问题：

1. 如何从结果中提取各种元素？在R他们将是out$coefficients和out$residuals等。我知道有这方面的文件，但我有点迷失。理想情况下，我希望元素采用有用的格式，因此pandas数据帧或索引列表等。
2. df会怎么样？ robjects.r()似乎只是保存你给的最后一件事，扔掉其他一切。我想我可以解决这个问题，但这并不理想。
3. 与2相关：有更好的方法吗？一般来说，如果有人可以为这类事情提出“最佳实践”，那将会有所帮助，因为我确信有很多人对使用Python感兴趣，但偶尔会有一个他们需要调用的非常自定义的函数R但是他们不想对整合有所了解。也许使用Pythonic输入参数调用R函数的方法会很棒。

Answer 1

问题1：如何从结果中提取各种元素？

Ans.1：运行R脚本后：

test = ro.r(your_R_script)

您可以使用此代码打印出names对象中的所有values和test。

# iterate on names and values
# be careful output is v long
for n,v in test.items():
    print(n)
    print(v)

要列出所有可用的names，请运行以下代码：

test.names

输出：

StrVector with 12 elements.
'coeffici... 'residuals' 'effects' 'rank' ... 'xlevels' 'call'  'terms' 'model'

要打印'残差'的值，请运行以下命令：

test[test.names.index('residuals')]

问题2：df会发生什么？

Ans.2：在您删除之前，它仍然可以在R环境中使用。您可以运行简单的R代码来检查：

ro.r('''
        # View dataframe
        df
        ''')

问题3：有更好的方法吗？

答案3 :(没有答案。）