Bash：如何一次提取3个文件的父目录

Question

我的文件名是这样的：

/foo/bar/bazz/JMA01023D_E07/JMA01023D_E07_EKDL230054768-1A_22HFKNLT3_L4_1.fq.gz
/foo/bar/bazz/JMA01023D_E08/JMA01023D_E08_EKDL230054768-1A_22HFKNLT3_L4_1.fq.gz
/foo/bar/bazz/JMA01023D_E09/JMA01023D_E09_EKDL230054768-1A_22HFKNLT3_L4_1.fq.gz
/foo/bar/bazz/JMA01022D_E06/JMA01022D_E06_EKDL230054767-1A_22HF2WLT3_L7_1.fq.gz
/foo/bar/bazz/JMA01001D_A01/JMA01001D_A01_EKDL230054750-1A_222T7MLT4_L1_1.fq.gz
/foo/bar/bazz/JMA01001D_A02/JMA01001D_A02_EKDL230054750-1A_222T7MLT4_L1_1.fq.gz

其中 3 个文件（完整路径，按字母顺序排序）形成一个三元组。 我想一次获取 3 个文件的父文件夹名称。

所以期望的输出是：

JMA01001D_A01 JMA01001D_A02 JMA01022D_E06
JMA01023D_E07 JMA01023D_E08 JMA01023D_E09

类似这样的：

find "$@" -iname '*_1.fq.gz' | sort | xargs -I % -n3 sh -c echo % | sed -r 's/ *[^ ]*\/([^ ]+)\/([^ ]+)/\1 /g\'

理想情况下，我想支持空间，所以带有

find -print0

、

sort -z

和

xargs -0

的东西将是理想的。 但我似乎无法让它发挥作用。

有人可以帮我理清我的大脑吗？ 它不必使用 sed，带有

dirname

/

basename

或

awk

的东西也可以......

Answer 1

您可以使用 awk 获取文件夹名称并将其通过管道传输到

xargs -n 3

以获得每行 3 个项目的输出：

... | awk -F'/' '{print $(NF-1)}' | xargs -n 3

---

JMA01023D_E07 JMA01023D_E08 JMA01023D_E09
JMA01022D_E06 JMA01001D_A01 JMA01001D_A02