查找包含所有缺失值的列

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我正在编写一个函数,需要检查(和哪个!)列(变量)是否具有所有缺失值(NA<NA>)。以下是该功能的片段:

test1 <- data.frame (matrix(c(1,2,3,NA,2,3,NA,NA,2), 3,3))
test2 <- data.frame (matrix(c(1,2,3,NA,NA,NA,NA,NA,2), 3,3))

na.test <-  function (data) {
  if (colSums(!is.na(data) == 0)){
      stop ("The some variable in the dataset has all missing value,
     remove the column to proceed")
      }
      }
na.test (test1)

Warning message:
In if (colSums(!is.na(data) == 0)) { :
  the condition has length > 1 and only the first element will be used

Q1:为什么上述错误和任何修复?

Q2:有没有办法找到哪些列都有NA,例如输出列表(变量名或列号)?

r dataframe na
5个回答
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使用sapply和一个小的匿名函数很容易:

sapply(test1, function(x)all(is.na(x)))
   X1    X2    X3 
FALSE FALSE FALSE 

sapply(test2, function(x)all(is.na(x)))
   X1    X2    X3 
FALSE  TRUE FALSE 

并且在一个函数内:

na.test <-  function (x) {
  w <- sapply(x, function(x)all(is.na(x)))
  if (any(w)) {
    stop(paste("All NA in columns", paste(which(w), collapse=", ")))
  }
}

na.test(test1)

na.test(test2)
Error in na.test(test2) : All NA in columns 2

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查找缺少所有值的列

 allmisscols <- apply(dataset,2, function(x)all(is.na(x)));  
 colswithallmiss <-names(allmisscols[allmisscols>0]);    
 print("the columns with all values missing");    
 print(colswithallmiss);

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在dplyr

ColNums_NotAllMissing <- function(df){ # helper function
  as.vector(which(colSums(is.na(df)) != nrow(df)))
}

df %>%
select(ColNums_NotAllMissing(.))

example:
x <- data.frame(x = c(NA, NA, NA), y = c(1, 2, NA), z = c(5, 6, 7))

x %>%
select(ColNums_NotAllMissing(.))

或者,反之亦然

Cols_AllMissing <- function(df){ # helper function
  as.vector(which(colSums(is.na(df)) == nrow(df)))
}


x %>%
  select(-Cols_AllMissing(.))

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要测试列是否包含所有缺失值:

apply(test1,2,function(x) {all(is.na(x))})

要获取哪些列具有所有缺失值:

  test1.nona <- test1[ , colSums(is.na(test1)) == 0]

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以下命令为您提供了一个包含NA值的列的漂亮表:

sapply(dataframe, function(x)all(any(is.na(x))))

这是对你得到的第一个答案的改进,在某些情况下无法正常工作。

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