如何压缩具有共同X列值的行并且只保留一个Y列值？

Question

我正在处理一个包含基因名称和 TPM 等变量的数据集。

基因	TPM
基因A	0.2
B基因	0.4
基因A	2.1

我想将任何出现不止一次的基因减少到一行，并且只报告该基因的最高 TPM，这样我的表格现在看起来像：

基因	TPM
基因A	2.1
B基因	0.4

我认为我的解决方案要么是过滤我现有的数据集，要么逐行循环遍历现有数据集以记录所有基因，并通过迭代将较低的 TPM 值替换为在 DF 中找到的较高值。

我正在努力使这些工作中的任何一个工作，并且不知道是否有另一种可能更好的解决方案。

非常感谢任何帮助。

Answer 1

根据提供的数据，您是否正在寻找这样的东西？

library(dplyr)

df %>%
  group_by(Gene) %>%
  summarise(TPM = max(TPM))

  gene    TPM
  <fct> <dbl>
1 A       2.1
2 B       0.4