在冠状方向上进行简单的 ITK 切片最终会得到颠倒的图像？

Question

SimpleITK 版本“2.2.0”。 Python版本3.9.3 Numpy 版本 1.24.2

我使用 SimpleITK 读取图像，然后在不同方向上对其进行切片。例如，图像是“image.mhd”，我将其读为：

image = sitk.ReadImage('image.mhd')

然后我通过以下方式在冠状视图上将其切片：

myslice = image[:, index, :]

然后我使用 satk.WriteImage(myslice, 'slice.mhd') 将此切片保存回 mhd。

当我将其加载回 ITK-Snap 时，图像是上下颠倒的。有什么理由吗？我做错了什么吗？

尝试对 SimpleITK 加载的图像进行切片

Answer 1

您的图像可能有非身份方向。在切片之前尝试使用 DICOMOrientImageFilter 和身份（LPS）方向。