使用conda环境时，如何像模块加载一样设置环境变量？

Question

我正在尝试填充配置文件，以便可以移植大型模型。按照文档的建议，执行此操作的正常方法是编写一个 shell 脚本，例如：

module load openmpi

、

module load netcdf

等等。通常，这会将相关路径添加到

PATH

、

MANPATH

、

LIBRARY_PATH

、

MPI_RUN

等。但是，因为我位于共享服务器上，无法将必要的包添加到可加载的列表中，所以选项是不可能的。

我有一个 conda 环境，其中包含所有正确的软件包设置。看看

printenv

的结果，conda 本身并没有向

PATH

、

MANPATH

等添加任何内容。也就是说，我承认我并不完全确定 conda 在幕后是如何工作的。

是否有一些巧妙的技巧可以将这些包路径添加到所有环境变量中，或者我是否必须手动添加它们？

谢谢！

Answer 1

您可以在 shell 脚本或环境设置脚本中手动添加必要环境变量的路径（例如 .bashrc 或 .bash_profile）。

为此，您可以使用“export”命令来设置环境变量的值。例如：

export PATH="/path/to/package1:/path/to/package2:$PATH"
export MANPATH="/path/to/manpages:/path/to/manpages2:$MANPATH"
export LIBRARY_PATH="/path/to/library:/path/to/library2:$LIBRARY_PATH"
export MPI_RUN="/path/to/mpirun:/path/to/mpirun2:$MPI_RUN"

您还可以使用“conda info”命令来获取conda环境中安装的包的路径。例如：

conda info --envs
# Lists all available conda environments

conda list -n myenv
# Lists all packages installed in the environment "myenv"enter code here

然后您可以在“export”命令中使用这些路径来设置环境变量的值。

请记住，这些更改将仅应用于您当前的 shell 会话。如果您希望这些更改持久存在，则需要将这些命令添加到环境设置脚本（例如 .bashrc 或 .bash_profile）中，以便每次启动新的 shell 会话时运行它们。