仅在某些不匹配模式的行上用sed替换

Question

我有一个文件（标准FASTA格式），如下所示。我想替换所有的“-”字符，但只能替换do n't >>以“>”开头的行。例如：

>Title1-mytitle
ACACAGCATGCTA-CTAGCAGT
>Title2
---CAGCTAGCAG-TGACGCGA
GTCAGCTGACGTAGCTAGTATA
CGATCGATCGTAGCT-GAGATT
>Title3-again-q
ATGCTAGCTGACTGATCGTCGG
ATGATGATTTG
输出想要这样：

>Title1-mytitle
ACACAGCATGCTACTAGCAGT
>Title2
CAGCTAGCAGTGACGCGA
GTCAGCTGACGTAGCTAGTATA
CGATCGATCGTAGCTGAGATT
>Title3-again-q
ATGCTAGCTGACTGATCGTCGG
ATGATGATTTG
我需要一个bash解决方案，才能将其放入更长的管道中。我在思考sed时使用了特别聪明的正则表达式。你有什么想法吗？

谢谢！

我有一个文件（标准FASTA格式），如下所示。我想替换所有的“-”字符，但只能替换不是以“>”开头的行。例如：> Title1-mytitle ...

Answer 1

!可用于排除搜索模式。在您的示例中，这看起来像：