是否可以在 MuMIn::dredge 函数中包含没有主效应的交互项?

问题描述 投票:0回答:1

我正在与 lme4 的 glmer 拟合进行一些模型比较。我的全局模型有 4 个固定效应和 1 个随机效应,加上 3 个固定效应之间的相互作用:

响应 ~ a + b * c * d + (1|e)

挖掘函数返回具有双重和三重交互的模型,但当包含涉及该变量的交互时,固定效应始终包含在模型中。我想将所有模型组合与这些变量进行比较,包括具有交互项而没有主效应的模型,例如:

响应 ~ a + b + b:c + (1|e) 或 响应 ~ a + c + b:c + a:b:c + (1|e)

这可以通过 dredge() 函数实现吗?或者对于实现这一目标的方法还有其他建议吗?有很多模型需要手动指定。

r glm mumin model-comparison
1个回答
0
投票

我首先警告你,只有在你有充分的理由这样做/知道自己在做什么的情况下,你才应该违反边缘性原则

MuMIn
按照它的方式设置默认值是有原因的.. .)。话虽如此:

  1. 使用
    model.matrix()
    构造固定效应组件所需的所有单独变量:
X <- model.matrix(~ a + b*c*d, data = yourdata)
colnames(X) <- make.names(colnames(X)) ## convert to syntactically allowed names
  1. 创建一个包含这些变量(以及随机效应分组变量)的新数据框,并使用
    reformulate()
    将所有这些变量与随机效应结合起来:
newdata <- data.frame(X, yourdata[c("e", "response")])
form <- reformulate(c(colnames(X), "(1|e)", response = "response")
  1. 适合模型:
model <- glmer(form, family = ..., data = newdata)
  1. 疏通!
© www.soinside.com 2019 - 2024. All rights reserved.