我尝试运行snakemake --tibanna
以使用Tibanna创建的“独角兽”步骤函数在AWS上部署Snakemake。
我似乎找不到改变Tibanna接受的不同参数的方法,例如将哪个子网,AZ或安全组用于实际部署的EC2实例。
参数示例(在不使用Snakemake的情况下运行Tibanna时:https://github.com/4dn-dcic/tibanna/blob/master/test_json/unicorn/shelltest4.json#L32
谢谢!
您是否注意到此选项?
snakemake --help
-tibanna-config TIBANNA_CONFIG [TIBANNA_CONFIG ...]其他tibanan配置,例如--tibanna-configspot_instance = true子网=安全组=
我认为它是最近添加的。
-jk