Snakemake-Tibanna配置支持

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我尝试运行snakemake --tibanna以使用Tibanna创建的“独角兽”步骤函数在AWS上部署Snakemake。

我似乎找不到改变Tibanna接受的不同参数的方法,例如将哪个子网,AZ或安全组用于实际部署的EC2实例。

参数示例(在不使用Snakemake的情况下运行Tibanna时:https://github.com/4dn-dcic/tibanna/blob/master/test_json/unicorn/shelltest4.json#L32

谢谢!

snakemake
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snakemake --help

-tibanna-config TIBANNA_CONFIG [TIBANNA_CONFIG ...]其他tibanan配置,例如--tibanna-configspot_instance = true子网=安全组=

我认为它是最近添加的。

-jk

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