10x Multiome 数据上的 Cell Ranger Arc 错误：没有 I2 读取 FASTQ，我们无法从 FASTQ 标头读取 16 基条形码

Question

我正在尝试对我的 FASTQ 文件运行 cellranger-arc 计数，这些文件是我在 NovaSeqX 上运行 10 倍多组测序而得到的（我将其提交给核心，他们将其解复用 - 我已经联系过，但由于假期，回复会很慢） )

当我运行 cellranger-arc count 并且上传到 10x 云分析时，我收到此错误：

[错误] Pipestance 失败。错误日志位于： 20231122GW18EC/SC_ATAC_GEX_COUNTER_CS/SC_ATAC_GEX_COUNTER/_ATAC_MATRIX_COMPUTER/MAKE_ATAC_SHARDS/fork0/chnk0-u909384e43f/_errors

记录消息： 无法读取读取 ID LH00416:29:22GF7TLT3:4:1101:1259:1032 1:N:0:NGCGTTTC 的条形码序列：没有 I2 读取 FASTQ，我们无法从 FASTQ 读取 16 碱基条形码标头。确保流动槽已正确分离。

我不认为我的错误与我的编码有关，因为我只是将其上传到 10x 云分析软件并得到了相同的错误。我用不同的方式命名和加载文件，但没有任何效果。我没有原始输出，我只有解复用的文件。

我只是想在等待（很长一段时间）从核心得到响应时排除故障。

Answer 1

您找到解决方案了吗？一位同事也遇到了同样的情况。