如何防止 Matplotlib 剪掉我的轴标签？

Question

我正在为一篇科学论文准备一些图表，这些图表需要又宽又短，以适应页数限制。但是，当我将它们另存为 pdf 时，x 轴标签丢失，因为（我认为）它们位于边界框之外。

将以下内容放入 iPython 笔记本中会重现该问题。

%pylab inline
pylab.rcParams['figure.figsize'] = (8.0, 2.0)
plot([1,5,2,4,6,2,1])
xlabel("$x$")
ylabel("$y$")
savefig("test.pdf")

生成的 pdf 文件如下所示：

如何更改 pdf 文件的边框？理想情况下，我想要一个“正确执行”的解决方案，即自动调整大小，以便一切都整齐地适合，包括摆脱左侧和右侧不必要的空间 - 但我很着急，所以我会接受任何改变边界框的方法，如果有必要的话，我会猜测数字，直到它看起来正确为止。

Answer 1

谷歌一番后，我找到了答案：你可以给

bbox_inches='tight'

命令赋予

savefig

，它会自动将边界框调整为内容的大小：

%pylab inline
pylab.rcParams['figure.figsize'] = (8.0, 2.0)
plot([1,5,2,4,6,2,1])
xlabel("$x$")
ylabel("$y$")
savefig("test.pdf",bbox_inches='tight')

我猜这些尺寸有点紧。

请注意，这与 Ffisegydd 的答案略有不同，因为它调整了绘图的边界框，而不是更改绘图以适合边界框。 （但两者都适合我的目的。）

Answer 2

您可以使用

plt.tight_layout()

让 matplotlib 调整绘图的布局。

tight_layout()

将自动调整尺寸，并且当您有（例如）重叠标签/刻度/等时也可以使用。

%pylab inline

pylab.rcParams['figure.figsize'] = (8.0, 2.0)

plot([1,5,2,4,6,2,1])

xlabel("$x$")
ylabel("$y$")

tight_layout()

savefig("test.pdf")

这是输出的 .png（无法将 pdf 上传到 SO，但我已经检查过，它的工作方式与 pdf 相同）。

Answer 3

如果您正在准备科学论文的情节，我建议您自己进行“剪辑”， 使用

plt.subplots_adjust(left,right,bottom,top,..)

创建图形之后和保存之前。如果您从 ipython 控制台运行，您还可以在生成图形后调用

subplots_adjust

，并通过反复试验调整边距。一些后端（我认为至少是 Qt 后端）也公开了此功能的 GUI。

手动执行此操作需要时间，但大多数时候可以提供更精确的结果，尤其是根据我的经验使用 Latex 渲染。

当您必须垂直或水平堆叠两个图形时（例如使用像

subfigure

这样的包），这是唯一的选择，因为

tight_layout

不能保证两个图形中的边距相同，并且轴将导致未对齐纸。

这是关于使用 matplotlib 进行出版物的一个很好的 link，例如涵盖如何设置图形宽度以匹配期刊列宽度。