在snakemake规则的日志部分指定日志而不是在参数中指定它有什么好处？

Question

我可以轻松地将其放在参数部分中，而不是使用规则的日志部分。唯一的区别是

log

的额外

params.

。事实上，通过将其放入参数中，我可以进行更多控制，因为我不需要日志包含所有通配符。例如，我可以使用

{params.log}

将多个进程附加到同一日志。除了可能使代码看起来更干净之外，为什么日志部分很有用？

Answer 1

文档

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日志文件可以用作其他规则的输入，就像任何其他输出文件一样。但是，与输出文件不同，日志文件在出现错误时不会被删除。为了发现可能在日志文件中可见的错误原因，这显然是必要的。

如果您使用

>>

进行日志记录，则无法使用日志文件作为其他规则的输入。话虽如此，我自己从来没有养成使用 log 指令的习惯。