如何从 mpirun 在 gnome 终端中运行 gdb？

Question

我有一个使用 mpi 的程序。要调试它，我可以使用

mpirun -np 2 xterm -e gdb myprog

。

但是，xterm 在我的机器上有问题。我想尝试 gnome-terminal 但我不知道该输入什么。我试过了：

1)

mpirun -np 2 gnome-terminal -- gdb myprog

2）

mpirun -np 2 gnome-terminal -- "gdb myprog"

3）

mpirun -np 2 gnome-terminal -- bash -c "gdb myprog"

4）

mpirun -np 2 gnome-terminal -- bash -c "gdb myprog; exec bash"

但这些似乎都不起作用； 1),3),4) 在 gdb 中的

run

之后说：

看起来 MPI_INIT 由于某种原因失败了；你的并行进程是 可能会中止。并行进程可以有很多原因 MPI_INIT 期间失败；其中一些是由于配置或环境造成的 问题。此故障似乎是内部故障；这是一些 附加信息（可能仅与开放 MPI 相关） 开发商）：

ompi_mpi_init：ompi_rte_init 失败

--> 返回“(null)”(-43) 而不是“成功”(0)

------------------------------------------------- ------------------------

*** MPI_Init 发生错误

*** 在 NULL 通信器上

*** MPI_ERRORS_ARE_FATAL（此通信器中的进程现在将中止，

*** 可能还有您的 MPI 工作）

[oleg-VirtualBox:4169] MPI_INIT 完成之前本地中止已成功完成，但无法聚合错误消息，并且无法保证所有其他进程都被终止！

[下级 1（进程 4169）退出，代码为 01]

2）终端显示：

为此终端创建子进程时出错

无法执行子进程“gdb app”（没有这样的文件或目录）

顺便说一句，我使用 Ubuntu 18.04.02 LTS。

我做错了什么？

编辑：事实证明，这不是有问题的 xterm，而是带有 --tui 选项的 gdb。如果您的程序打印某些内容，无论在哪个终端，gdb 窗口都将开始错误地显示内容。

Answer 1

问题是gnome-terminal将请求的程序交给终端服务器，然后立即退出。 mpirun 然后发现启动的程序已退出，并销毁 MPI 运行时环境。当MPI程序真正启动时，mpirun已经退出。据我所知，没有办法让 gnome-terminal 等待给定的命令结束。

有一个解决方法：不要直接使用 mpirun 启动 gnome-terminal，而是使用两个包装脚本。第一个由 mpirun 启动。它创建一个临时文件，告诉 gnome-terminal 启动第二个包装器脚本，然后等待直到临时文件消失。第二个包装器脚本运行您实际想要运行的命令，例如

gdb myprog

，等待结束，然后删除临时文件。此时，第一个包装器注意到临时文件消失并退出。然后mpirun就可以安全地破坏MPI环境了。

从脚本本身来看，这可能更容易理解。

调试.sh：

#!/bin/bash
# This is run outside gnome-terminal by mpirun.

# Create a tmp file that we can wait on.
export MY_MPIRUN_TMP_FILE="$(mktemp)"

# Start the gnome-terminal. It will exit immediately.
# Call the wrapper script which removes the tmp file
# after the actual command has ended.
gnome-terminal -- ./helper.sh "$@"

# Wait for the file to disappear.
while [ -f "${MY_MPIRUN_TMP_FILE}" ] ; do
    sleep 1
done

# Now exit, so mpirun can destroy the MPI environment
# and exit itself.

helper.sh

#!/bin/bash
# This is run by gnome-terminal.

# The command you actually want to run.
"$@"

# Remove the tmp file to show that the command has exited.
rm "${MY_MPIRUN_TMP_FILE}"

运行它作为

mpirun debug.sh gdb myproc

。

Answer 2

回复相当晚，但对于仍然发现此问题的人来说，一个相当简洁的解决方案是：

mpirun -np N gnome-terminal --wait -- gdb -ex run --args myprog arg1 arg2

关键是

gnome-terminal --wait

，正如它所暗示的，在终止终端之前等待子进程终止。

如果可能的话，我建议减少进程数，因为进程数很多，这种方法变得非常麻烦。