snakemake 运行的唯一 ID

Question

运行 Nextflow 管道时，唯一的 ID 与整个运行相关联。例如，它可以通过检查

nextflow log

来获得。我正在为 Snakemake 管道寻找相同的功能。如何为完整的 Snakemake 管道运行获取这样一个唯一的 ID？

干杯

Answer 1

当你运行管道时，snakemake会在

/path/to/working_dir/.snakemake/log

中创建一个日志文件，以当前时间和进程ID命名（我认为这是一个进程ID，但这并不重要）。例如：

output/.snakemake/log/2023-09-11T172850.914729.snakemake.log

。我猜这个文件的名称可以作为运行ID。也许解释为什么你需要一个运行 ID 可以提示更好的答案。