我一直在使用snakemake implementation of the GATK pipeline的修改版进行基因分型。管道首先将读取映射到参考，并为每个样本调用变体。随后，在基因分型步骤中共同分析变体。现在，我要运行部分基于相同样本的新分析工作流程。
是否有一种方法可以重复使用先前分析工作流程中特定于样本的规则结果，从而无需重新计算它们？最佳做法是什么？例如复制/符号链接数据或在工作流缓存之间使用（可以追溯地进行缓存）吗？
任何建议都非常感谢。谢谢
我认为您正在寻找的是Between workflow caching。我认为文档完全解释了概念+实现。让我知道这是否对您不起作用：）