match（x，table，nomatch = 0L）中的错误：'match'需要向量参数

Question

我正在尝试在R Studio云上进行一些Bioconductor练习。运行前两个代码（＃1，＃2）已经可以了，但是最后一个代码（＃3）给出了错误消息。任何人都可以帮忙吗？

#1 Transcribe dna_seq into an RNAString object and print it
 dna_seq <- subseq(unlist(zikaVirus), end = 21)
 dna_seq
  21-letter "DNAString" instance
seq: AGTTGTTGATCTGTGTGAGTC



#2 Transcribe dna_seq into an RNAString object and print it
 rna_seq <- RNAString(dna_seq) 
 rna_seq
  21-letter "RNAString" instance
seq: AGUUGUUGAUCUGUGUGAGUC

#3 Translate rna_seq into an AAString object and print it
aa_seq <- translate(rna_seq)
aa_seq

 aa_seq <- translate(rna_seq)

match（x，table，nomatch = 0L）中的错误：'match'需要向量参数aa_seq错误：找不到对象'aa_seq'

Answer 1

谢谢。我设法解决了这个问题：我认为与translate（）函数发生冲突，因为seqinr和Biostring包都使用了它（我同时加载了这两个包）。我必须卸载seqinr，因为我正在做的练习是基于Biostring软件包的。