Entrez eFetch登录号

Question

我们目前正在研究一个项目，需要从ClinVar访问'NP_'登录号。但是，当我们使用Entrez.eFetch（）函数时，结果中似乎缺少此信息。这是指向列出NP_号的网站页面的链接：

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/variation/558834/

这是获取XML结果的Python示例脚本代码：

handle = Entrez.efetch(db="clinvar", id=558834, rettype='variation', retmode="text")
print(handle.read())

有趣的是，此[[used]返回结果中的NP号，但是，网站的格式/样式似乎与上次开发Python脚本时发生了变化，因此似乎无法弄清楚如何检索现在的NP号。

任何帮助将不胜感激！谢谢您的时间和投入！

Answer 1

您需要将其格式化为new query而不是old one：

handle = Entrez.efetch(db="clinvar", id=558834, rettype='vcv', is_varationid="true", from_esearch="true")
print(handle.read())

另请参见：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/docs/maintenance_use/