R 中函数与向量参数的积分

Question

我有一个与上一篇文章类似的挑战：如何传递向量来积分函数

我有一个函数，我想对曲线下的面积进行积分。

一、【生存】功能：

surv <- function(x,score) exp(-0.0405*exp(score)*x) # probability of survival

score

来自风险计算器，它调整生存估计。患者有不同的分数，例如：

score <- c(0.5, 0.6, 0.7, 0.8, 0.9, 1, 1.1) # 7 different scores

如果我们心中有一个特定的时间点

surv

，计算所有 7 名患者的

x

是很容易的：

surv(5, score) # Survival to year 5
[1] 0.7161497 0.6914399 0.6651219 0.6371998 0.6077026 0.5766890 0.5442516

但是为了获得群体的平均生存率或个体的预期生存率，我需要计算曲线下的面积，其中曲线由函数

surv

给出。我需要计算

x=0

和

x=Inf

限制下的面积。我需要对所有 7 名（在本例中）患者执行此操作。

我引用的另一篇 stackoverflow 帖子也有类似的问题。目前尚不清楚该解决方案是否可以帮助我。我在下面介绍一下：

integrate(Vectorize(fun_integrate,vectorize.args='x'), upper = 3, lower = -3, vec = rnorm(100),subdivisions=10000)

fun_integrate

是要集成的功能

vectorize.args

是要向量化并传递给 fun_integrate 的参数

vec

是作为参数传递到 fun_integrate

的值向量

我不知道细分是什么，但我认为这并不重要。

我尝试使用以下命令执行此操作：

integrate(Vectorize(surv, vectorize.args="score"), lower=0, upper=Inf, score=score)
Error in integrate(Vectorize(surv, vectorize.args = "score"), lower = 0,  : 
  evaluation of function gave a result of wrong length

我尝试了不同的修改，但似乎没有任何结果。

你有什么建议吗？

Answer 1

您的操作顺序错误。您需要创建一个函数来计算给定分数的积分，并将其矢量化。

surv <- function(x,score) exp(-0.0405*exp(score)*x) # probability of survival
area <- function(score) integrate(surv,lower=0,upper=Inf,score=score)$value
v.area <- Vectorize(area)

scores <- c(0.5, 0.6, 0.7, 0.8, 0.9, 1, 1.1)  # 7 different scores
v.area(scores)
# [1] 14.976066 13.550905 12.261366 11.094542 10.038757  9.083443  8.219039