提取并添加到基于一个斯坦线性模型的概率密度函数的数据值

问题描述 投票:2回答:1

鉴于样本数据sampleDT和模型lm.fit及以下brm.fit,我想:

估计,提取物和添加到数据帧中的密度函数的值在可变dollar.wage_1的观测水平评价条件正态分布。

我可以用一个频率论线性回归lm.fitdnorm但我尝试使用贝叶斯模型brm.fit不能做同样做到这一点。因此,任何帮助将不胜感激。

##样本数据

sampleDT<-structure(list(id = 1:10, N = c(10L, 10L, 10L, 10L, 10L, 10L, 
    10L, 10L, 10L, 10L), A = c(62L, 96L, 17L, 41L, 212L, 143L, 143L, 
    143L, 73L, 73L), B = c(3L, 1L, 0L, 2L, 170L, 21L, 0L, 33L, 62L, 
    17L), C = c(0.05, 0.01, 0, 0.05, 0.8, 0.15, 0, 0.23, 0.85, 0.23
    ), employer = c(1L, 1L, 0L, 1L, 0L, 1L, 1L, 0L, 0L, 0L), F = c(0L, 
    0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L), G = c(1.94, 1.19, 1.16, 
    1.16, 1.13, 1.13, 1.13, 1.13, 1.12, 1.12), H = c(0.14, 0.24, 
    0.28, 0.28, 0.21, 0.12, 0.17, 0.07, 0.14, 0.12), dollar.wage_1 = c(1.94, 
    1.19, 3.16, 3.16, 1.13, 1.13, 2.13, 1.13, 1.12, 1.12), dollar.wage_2 = c(1.93, 
    1.18, 3.15, 3.15, 1.12, 1.12, 2.12, 1.12, 1.11, 1.11), dollar.wage_3 = c(1.95, 
    1.19, 3.16, 3.16, 1.14, 1.13, 2.13, 1.13, 1.13, 1.13), dollar.wage_4 = c(1.94, 
    1.18, 3.16, 3.16, 1.13, 1.13, 2.13, 1.13, 1.12, 1.12), dollar.wage_5 = c(1.94, 
    1.19, 3.16, 3.16, 1.14, 1.13, 2.13, 1.13, 1.12, 1.12), dollar.wage_6 = c(1.94, 
    1.18, 3.16, 3.16, 1.13, 1.13, 2.13, 1.13, 1.12, 1.12), dollar.wage_7 = c(1.94, 
    1.19, 3.16, 3.16, 1.14, 1.13, 2.13, 1.13, 1.12, 1.12), dollar.wage_8 = c(1.94, 
    1.19, 3.16, 3.16, 1.13, 1.13, 2.13, 1.13, 1.12, 1.12), dollar.wage_9 = c(1.94, 
    1.19, 3.16, 3.16, 1.13, 1.13, 2.13, 1.13, 1.12, 1.12), dollar.wage_10 = c(1.94, 
    1.19, 3.16, 3.16, 1.13, 1.13, 2.13, 1.13, 1.12, 1.12)), row.names = c(NA, 
    -10L), class = "data.frame")

##频率论模​​型:该作品

lm.fit <-lm(dollar.wage_1 ~ A + B + C + employer + F + G + H,
            data=sampleDT)

sampleDT$dens1 <-dnorm(sampleDT$dollar.wage_1,mean=lm.fit$fitted,
sd=summary(lm.fit)$sigma) 

##贝叶斯模型:这是我的尝试 - 这是行不通的

//this works
brm.fit <-brm(dollar.wage_1 ~ A + B + C + employer + F + G + H,
            data=sampleDT, iter = 4000, family = gaussian())

//this does not work
 sampleDT$dens1_bayes <-dnorm(sampleDT$dollar.wage_1, mean = fitted(brm.fit), sd=summary(brm.fit)$sigma) 

错误dnorm(sampleDT $ dollar.wage_1,平均= brm.fit $装,SD =汇总(brm.fit)$西格玛):非数值参数的数学函数

在此先感谢您的帮助。

r bayesian probability-density stan rstan
1个回答
1
投票

我们现在fitted(brm.fit)是一个矩阵,所以我们希望只使用它的第一列 - 这估计。此外,由于没有任何理由为对象的结构是一样的,summary(brm.fit)$sigma给什么。相反,你要summary(brm.fit)$spec_pars[1]。因此,你可以使用

sampleDT$dens1_bayes <- dnorm(sampleDT$dollar.wage_1,
                              mean = fitted(brm.fit)[, 1],
                              sd = summary(brm.fit)$spec_pars[1])
© www.soinside.com 2019 - 2024. All rights reserved.