Bioconductor提供了分析和理解R语言中高通量基因组数据的工具。
我在我的ubuntu上安装了R（3.4.0）。我想使用EdgeR包。我尝试按照Bioconductor网站上提供的安装说明安装Bioconductor软件包。我用了 ...
我正在尝试使用他们网站上的代码将Bioconductor安装到R中。当我输入代码时（见下文）我收到一条错误消息，说某些软件包无法更新，安装...
无效的类“GRanges”对象：1：'x @ seqnames'与'x不平行
这个简单的代码：库（GenomicRanges）GRanges（c（“chr1”，“chr1”，“chr1”），c（109810200,109810201,109810544））失败，有一个相当神秘的异常：validObject（.Object）中的错误：.. 。
我试图在R中安装一个包，但无法解决以下错误。到底是怎么回事？ :(我正在运行Fedora 20，R 3.2 biocLite（“monocle”）BioC_mirror：http：//bioconductor.org ...
ComplexHeatMap - 在基础数据集中按顺序排序行，但不在最终热图中显示订单列
我想订购一个4 x热图的Complexheatmap，它按行顺序连接在一起，它包含在底层数据集的'Order'列中，但是我不希望订单列/数据可见...
我有一个xstringset对象一个长度为151674宽度的DNAStringSet实例seq名称[1] 253 ...
假设我有这个DNAStringSet（作为示例）dataset1一个长度为38874的DNAStringSet实例seq名称[1] 2617 GGC黄色[2] 4306 ACG蓝色[3] ...
如何在.Hub（“AnnotationHub”，hub，cache，proxy，localHub，...）中修复错误
我在R中使用REMP包来找到重复元素中的甲基化。我偶然发现函数initREMP，它给了我错误：remparcel
我正在使用ComplexHeatmap来绘制数据，但是，每当我开始划分矩阵以便更容易读取时，我的行/列的顺序似乎被洗牌。我想知道我是不是......
在闪亮的flexdashboard上加载RBioFormats时出错
我有一个使用flexdashboard的闪亮应用程序，我想继续前一段时间开始的开发过程。这个应用程序使用Bioconductor的RBioFormats包，现在我......
我不擅长使用apply系列函数。我想使用apply系列函数而不是跟随类型的嵌套循环迭代9076 x 9076次以提高计算速度。最小的......
我在R的Bioconductor包中使用hmdbquery包来过滤HMDB数据库中记录的一些代谢物的浓度。我指的是可用的hmdbquery手册......
我想使用GenomicFeatures和Bioconductor的TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene R软件包从我的列表（由hgnc基因id组成）中获取人类基因的坐标。库（TxDb.Hsapiens ....
使用Biomart hsapiens_gene_ensembl数据集时出现错误消息。谁知道怎么解决？
这是我以前尝试连接到hsapiens数据集的代码：> mart
在R中，可以使用csv.write将bioconductor ExpressionSet写入csv文件。例如，使用可用作bioconductor包的标准膀胱填充数据，以下代码编写csv ...
我试图从CRAN打包一些R包以在conda环境中使用，因为我使用Python和R包的组合用于生物信息学管道。由于其他依赖，我......
我试图在R脚本的Ubuntu 16.04上自动安装Bioconductor及其不同的软件包。但是，每个安装都需要交互来说 - 是，是的我想安装它和-...
我想删除包含chr1_ _random的行，然后根据chr和start列对数据进行排序：data：Coordinates chr start end ...
WGCNA分析结果为我们提供了几个模块。这些模块是彩色的，也可以用数字编号。通常灰色模块在数字中也标记为0对应于...的集合。
我想要一些帮助。我有一个21行的矩阵和一个先前未定义的列数（取决于输入）。每个单元格都有一个数字，表示该行元素出现的次数...